More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1728 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 
410 aa  840    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  73.1 
 
 
415 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  69.46 
 
 
410 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  58.89 
 
 
457 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  61.48 
 
 
418 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  55.61 
 
 
451 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  58.23 
 
 
419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  57.11 
 
 
414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  47.43 
 
 
411 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  45.21 
 
 
416 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  46.81 
 
 
409 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  47.15 
 
 
387 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  50.61 
 
 
421 aa  339  5e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  40.05 
 
 
412 aa  306  6e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  45.59 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  42.79 
 
 
399 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  45.33 
 
 
414 aa  279  5e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  42.3 
 
 
403 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  40.29 
 
 
400 aa  262  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  40.49 
 
 
400 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  41.22 
 
 
407 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  42.09 
 
 
403 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  45.85 
 
 
407 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.59 
 
 
444 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  36.32 
 
 
398 aa  229  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  35.45 
 
 
425 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  34.94 
 
 
412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  34.28 
 
 
626 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.62 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  32.61 
 
 
442 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  33.02 
 
 
420 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  36.25 
 
 
397 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  33.25 
 
 
665 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.73 
 
 
604 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  33.73 
 
 
604 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  33.49 
 
 
682 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  34.2 
 
 
688 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.49 
 
 
406 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  32.3 
 
 
414 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  33.73 
 
 
666 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.94 
 
 
408 aa  204  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.43 
 
 
605 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 
650 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.57 
 
 
621 aa  202  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.02 
 
 
666 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.54 
 
 
560 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.57 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.04 
 
 
417 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.41 
 
 
429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.7 
 
 
774 aa  200  5e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.6 
 
 
673 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.41 
 
 
429 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  34.12 
 
 
661 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.41 
 
 
419 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.28 
 
 
412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0933  putative cysteine desulfurase  33.49 
 
 
671 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.83 
 
 
644 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.41 
 
 
429 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1407  putative cysteine desulfurase  33.49 
 
 
660 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0448  putative cysteine desulfurase  33.49 
 
 
660 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0199  putative cysteine desulfurase  33.49 
 
 
660 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.75031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.25 
 
 
641 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.21 
 
 
420 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.36 
 
 
425 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  31.28 
 
 
410 aa  196  6e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.6 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.12 
 
 
664 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0362  selenocysteine lyase  33.25 
 
 
685 aa  196  9e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.556152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.15 
 
 
418 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  35.77 
 
 
399 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.97 
 
 
672 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1904  cysteine desulphurases, SufS  33.25 
 
 
660 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.256271  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1818  SufS family cysteine desulfurase  33.25 
 
 
660 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.97 
 
 
674 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  30.92 
 
 
420 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.54 
 
 
417 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.65 
 
 
404 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.38 
 
 
408 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2039  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.32 
 
 
610 aa  192  8e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.3 
 
 
408 aa  192  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.79 
 
 
412 aa  192  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  33.17 
 
 
408 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  32.31 
 
 
412 aa  191  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.65 
 
 
420 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.13 
 
 
406 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.31 
 
 
630 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  30.35 
 
 
420 aa  189  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.37 
 
 
414 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  30.38 
 
 
405 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.51 
 
 
435 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0754  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.99 
 
 
608 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.85 
 
 
419 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03051  putative cysteine desulfurase or selenocysteine lyase  32.61 
 
 
434 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.512887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.75 
 
 
407 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.41 
 
 
412 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.85 
 
 
419 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.99 
 
 
407 aa  188  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.88 
 
 
451 aa  188  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  30.73 
 
 
411 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.24 
 
 
406 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>