More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4526 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 412 aa  819    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  41.99 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  43.68 
 
 		 409 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  41.45 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  41.05 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  45.41 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  44.93 
 
 		 412 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  42.01 
 
 		 437 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  33.85 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  35.51 
 
 		 410 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  36.48 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  36.67 
 
 		 411 aa  226  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  34.94 
 
 		 410 aa  225  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  31.79 
 
 		 451 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  34.21 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  36.12 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  35.59 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  35.87 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  34.36 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  37.96 
 
 		 399 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  32.46 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  35.45 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  37.71 
 
 		 400 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  38.37 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  36.97 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  38.28 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  31.39 
 
 		 387 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  36.45 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  33.82 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  34.8 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  34.47 
 
 		 400 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  35.99 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  34.1 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  33.89 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1144  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.96 
 
 		 432 aa  156  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.37 
 
 		 406 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  33.26 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  31.91 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.94 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.97 
 
 		 449 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  32.12 
 
 		 424 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.02 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.01 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.48 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  33.58 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.48 
 
 		 417 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.86 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  33.89 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21910  cysteine desulfurase  31.6 
 
 		 435 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2506  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.29 
 
 		 421 aa  146  9e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.84 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5150  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.18 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.93 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  33.49 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.17 
 
 		 418 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.17 
 
 		 408 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.54 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0815  selenocysteine lyase  29.53 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.643683  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  29.51 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  32.14 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.21 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 413 aa  139  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  30.56 
 
 		 421 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.65 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0726  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2187  aminotransferase class V  32.77 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.25 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.01 
 
 		 412 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.77 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.14 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.93 
 
 		 650 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  31.57 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.21 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 419 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.02 
 
 		 885 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.7 
 
 		 666 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  31.44 
 
 		 452 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.45 
 
 		 421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  28.85 
 
 		 880 aa  133  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  29.68 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.21 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  33.65 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 572 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.21 
 
 		 406 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  28.27 
 
 		 682 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  26.43 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.79 
 
 		 407 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.97 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  28.37 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  29.47 
 
 		 666 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0997  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.07 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537591  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.3 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.7 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  28.74 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  29.01 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  28.74 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  27.01 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.3 
 
 		 414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>