More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13812 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13812  aminotransferase  100 
 
 		 398 aa  783    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.609711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4989  cysteine desulphurase-like protein  78.89 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5077  cysteine desulfurase family protein  78.89 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5370  cysteine desulfurase family protein  78.89 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5616  cysteine desulfurase family protein  77.64 
 
 		 398 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316888  normal  0.823554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1188  cysteine desulfurase family protein  77.14 
 
 		 398 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0280  cysteine desulfurase family protein  54.77 
 
 		 398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  54.39 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4098  cysteine desulfurase family protein  52.9 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  50.25 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  46.35 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  39.25 
 
 		 403 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  40.25 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  35.77 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  35.66 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  30.31 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  30.02 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  30.41 
 
 		 411 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  35.91 
 
 		 414 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  31.43 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  28.68 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  32.29 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  30.08 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  29.03 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  28.67 
 
 		 457 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  32.35 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  30.15 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  29.18 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  33.42 
 
 		 421 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  26.85 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  31.03 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  26.46 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  29.27 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  30.56 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  28.26 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  30.5 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  23 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.6 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  22.76 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.12 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  29.68 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.09 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.25 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.54 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  30.9 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  26.46 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.47 
 
 		 621 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  24.34 
 
 		 444 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 644 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.15 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.44 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.19 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.73 
 
 		 664 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  26.01 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.2 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  26.15 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.03 
 
 		 673 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.75 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.54 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.47 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  27.21 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.27 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  25.51 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.03 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  23.11 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.58 
 
 		 560 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.9 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  24.51 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.35 
 
 		 605 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.56 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.33 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  22.78 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.62 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  27.18 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.3 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  23.6 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  25.12 
 
 		 665 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.25 
 
 		 604 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.49 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  26.25 
 
 		 604 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.86 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0543  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.79 
 
 		 679 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.7 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.14 
 
 		 421 aa  102  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  22.95 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.02 
 
 		 662 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  23.38 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  27.95 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  23.66 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  25.18 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  27.59 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.94 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  21.68 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1675  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.76 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.67 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  24.58 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.3 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.32 
 
 		 672 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  23.21 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>