More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0729 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  100 
 
 
393 aa  806    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  62.76 
 
 
392 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1941  aminotransferase class V  47.14 
 
 
394 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0312599  normal  0.253942 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  48.05 
 
 
880 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1984  aminotransferase, class V  45.19 
 
 
394 aa  352  5e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.278859  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1215  aminotransferase class V  46.11 
 
 
393 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  47.72 
 
 
885 aa  347  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  45.83 
 
 
878 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.07 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.94 
 
 
406 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.07 
 
 
406 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  46.89 
 
 
896 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.26 
 
 
413 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.26 
 
 
413 aa  330  3e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.72 
 
 
415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2203  aminotransferase, class V  40.98 
 
 
393 aa  325  9e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.697874  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  42.26 
 
 
413 aa  322  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  42.54 
 
 
406 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  42.54 
 
 
406 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  42.54 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  42.54 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.79 
 
 
406 aa  319  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  42 
 
 
406 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  42.29 
 
 
406 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  42.54 
 
 
406 aa  317  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  42.54 
 
 
406 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  42.54 
 
 
406 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  42.25 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.32 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.25 
 
 
408 aa  311  2e-83  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.11 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  40.25 
 
 
410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.52 
 
 
418 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  44.03 
 
 
406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.5 
 
 
414 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  42.79 
 
 
406 aa  306  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.28 
 
 
418 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.98 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.48 
 
 
415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.29 
 
 
410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.25 
 
 
413 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.79 
 
 
413 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  39.95 
 
 
410 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.81 
 
 
406 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  40.62 
 
 
395 aa  301  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.25 
 
 
413 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.71 
 
 
406 aa  299  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.54 
 
 
413 aa  299  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.15 
 
 
404 aa  299  7e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.86 
 
 
414 aa  298  8e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.16 
 
 
414 aa  298  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.81 
 
 
406 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.56 
 
 
406 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.91 
 
 
414 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.81 
 
 
406 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  42.93 
 
 
414 aa  297  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  42.42 
 
 
408 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.73 
 
 
420 aa  297  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.75 
 
 
412 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  42.21 
 
 
414 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.9 
 
 
407 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.6 
 
 
418 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  42.21 
 
 
414 aa  296  6e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  41.85 
 
 
416 aa  296  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.05 
 
 
414 aa  295  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.12 
 
 
414 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.95 
 
 
412 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.83 
 
 
406 aa  295  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  41.56 
 
 
406 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.69 
 
 
404 aa  295  1e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  41.56 
 
 
406 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.26 
 
 
428 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.56 
 
 
406 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.73 
 
 
406 aa  294  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  40.35 
 
 
626 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.09 
 
 
451 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.71 
 
 
414 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.32 
 
 
406 aa  293  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  41.63 
 
 
414 aa  293  4e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  42.43 
 
 
406 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.59 
 
 
406 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.32 
 
 
414 aa  293  5e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.84 
 
 
406 aa  292  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.35 
 
 
417 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.59 
 
 
406 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  39.8 
 
 
420 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.59 
 
 
406 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.59 
 
 
406 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.05 
 
 
415 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.69 
 
 
415 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.85 
 
 
629 aa  291  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  41.35 
 
 
406 aa  290  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.69 
 
 
406 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.18 
 
 
406 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  40.59 
 
 
406 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  38.48 
 
 
412 aa  290  3e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.71 
 
 
414 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.77 
 
 
415 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.2 
 
 
426 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  41.28 
 
 
879 aa  288  9e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>