More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3379 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  94.01 
 
 
401 aa  772    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  100 
 
 
401 aa  817    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  73.32 
 
 
401 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  72.82 
 
 
401 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  70.32 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  70.32 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  70.07 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  70.07 
 
 
401 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  70.32 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  70.32 
 
 
401 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  70.32 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  69.83 
 
 
401 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  69.58 
 
 
401 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  69.33 
 
 
401 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  69.83 
 
 
401 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  69.08 
 
 
401 aa  566  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  70.32 
 
 
401 aa  565  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  68.08 
 
 
401 aa  556  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  68.58 
 
 
401 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  68.58 
 
 
401 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  68.58 
 
 
401 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  68.33 
 
 
401 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  68.33 
 
 
401 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  53.23 
 
 
404 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  50.25 
 
 
403 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  51 
 
 
403 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  45.68 
 
 
405 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.84 
 
 
429 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.84 
 
 
429 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.58 
 
 
429 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.32 
 
 
418 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  46 
 
 
399 aa  353  4e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.5 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  44.91 
 
 
414 aa  349  6e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.61 
 
 
417 aa  347  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.72 
 
 
419 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.72 
 
 
417 aa  346  4e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.67 
 
 
429 aa  345  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  45.83 
 
 
420 aa  345  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.39 
 
 
404 aa  344  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.48 
 
 
425 aa  343  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.5 
 
 
657 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  40.8 
 
 
405 aa  338  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  40.8 
 
 
405 aa  337  9.999999999999999e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.94 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.24 
 
 
408 aa  336  5e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.54 
 
 
421 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  42.93 
 
 
413 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.99 
 
 
420 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 
413 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  44.23 
 
 
417 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.43 
 
 
662 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  41.23 
 
 
404 aa  330  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  45.67 
 
 
404 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.68 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.59 
 
 
664 aa  326  5e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.22 
 
 
407 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.78 
 
 
572 aa  325  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.47 
 
 
407 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.25 
 
 
417 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  45.39 
 
 
401 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  45.98 
 
 
401 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4090  aminotransferase class V  44.39 
 
 
401 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.5 
 
 
408 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.95 
 
 
410 aa  323  3e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.32 
 
 
420 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.33 
 
 
673 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.73 
 
 
416 aa  322  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.04 
 
 
406 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.28 
 
 
406 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.86 
 
 
413 aa  322  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  45.14 
 
 
401 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.62 
 
 
672 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  41.11 
 
 
569 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.62 
 
 
674 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.57 
 
 
678 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.58 
 
 
412 aa  322  9.999999999999999e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.34 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  43.49 
 
 
414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  44.22 
 
 
430 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.45 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.09 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  44.89 
 
 
401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.58 
 
 
406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.22 
 
 
413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.09 
 
 
406 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.57 
 
 
406 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  45.23 
 
 
401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.74 
 
 
419 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  42.96 
 
 
422 aa  319  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.33 
 
 
406 aa  319  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  39.15 
 
 
408 aa  319  6e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.84 
 
 
406 aa  318  7.999999999999999e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.58 
 
 
427 aa  318  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.49 
 
 
419 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.33 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.69 
 
 
414 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.85 
 
 
414 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.95 
 
 
404 aa  317  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.33 
 
 
406 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>