More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0879 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  100 
 
 		 387 aa  805    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  68.13 
 
 		 411 aa  564  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  66.32 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  63.9 
 
 		 409 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  46.89 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  45.33 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  46.85 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  47.15 
 
 		 410 aa  359  4e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  44.68 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  45.45 
 
 		 415 aa  352  8.999999999999999e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  45.19 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  44.36 
 
 		 418 aa  349  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  43.53 
 
 		 451 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  42.89 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  41.09 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  39.06 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0289  cysteine desulfurase family protein  36.43 
 
 		 407 aa  242  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  38.79 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2142  cysteine desulfurase family protein  38.92 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.528034  normal  0.0416996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  35.84 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  36.93 
 
 		 414 aa  229  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  35.92 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  37.11 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  35.4 
 
 		 403 aa  222  7e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  36.08 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  32.31 
 
 		 425 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  32.26 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  32.08 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.4 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.25 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0136  cysteine desulfurase family protein  31.04 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.75 
 
 		 406 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.96 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.53 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.71 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.67 
 
 		 417 aa  179  5.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  31.34 
 
 		 423 aa  179  9e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  31.04 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.09 
 
 		 420 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01610  cysteine desulfurase family protein, VC1184 subfamily  31.71 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.129421  normal  0.129157 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.54 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  30.94 
 
 		 665 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0617  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.85 
 
 		 621 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000358817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.75 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  32.49 
 
 		 408 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 644 aa  172  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  31.59 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.93 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.18 
 
 		 413 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.05 
 
 		 605 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  29.72 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  28.75 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.68 
 
 		 673 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.85 
 
 		 604 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  30.85 
 
 		 604 aa  169  7e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.43 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.53 
 
 		 404 aa  169  9e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.43 
 
 		 418 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.09 
 
 		 672 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.13 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.09 
 
 		 674 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.27 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.22 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_19438  predicted protein  31.17 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.17 
 
 		 664 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.9 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  31.16 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  28.21 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.63 
 
 		 406 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.18 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  31.39 
 
 		 412 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  27.96 
 
 		 405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.1 
 
 		 774 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.8 
 
 		 404 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  29.68 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  27.83 
 
 		 422 aa  166  8e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  29.68 
 
 		 406 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  29.98 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  29.68 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.98 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  29.68 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  29.68 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  29.98 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.78 
 
 		 650 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.29 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.64 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  29.7 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.3 
 
 		 419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  30.1 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.89 
 
 		 560 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.98 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.98 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.98 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.2 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  29.73 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  28.54 
 
 		 688 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>