More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2982 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2982  cysteine desulfurase family protein  100 
 
 		 425 aa  878    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4526  Cysteine desulfurase  41.99 
 
 		 412 aa  312  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1442  aminotransferase, class V  38.65 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.259917  normal  0.109823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3113  cysteine desulfurase family protein  35.77 
 
 		 415 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000139968  hitchhiker  0.00618461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  35.24 
 
 		 410 aa  239  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003742  cysteine desulfurase  33.5 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.180127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3869  cysteine desulfurase family protein  33.58 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3645  cysteine desulfurase family protein  31.69 
 
 		 451 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4166  cysteine desulphurase-like protein  32.93 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744365  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0814  aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1728  cysteine desulfurase family protein  35.36 
 
 		 410 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0576314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1826  cysteine desulphurase-like protein  31.19 
 
 		 457 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2142  NifS-related protein  36.17 
 
 		 412 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0816  aminotransferase, class V  36.17 
 
 		 412 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28070  cysteine desulfurase-like protein  33.09 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.622503  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02028  hypothetical protein  31.57 
 
 		 412 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1455  cysteine desulfurase family protein  32.47 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000306553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0343  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394645  normal  0.251773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1449  cysteine desulfurase family protein  32.27 
 
 		 414 aa  209  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1436  aminotransferase class V  33.01 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0879  NifS-related protein, putative aminotransferase  32.31 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35946  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0805  aminotransferase, class V  31.92 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1769  cysteine desulfurase family protein  32.67 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1756  cysteine desulfurase family protein  33.58 
 
 		 403 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.115577  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3807  cysteine desulfurase family protein  33.33 
 
 		 399 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4945  cysteine desulfurase family protein  33.66 
 
 		 400 aa  186  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.32 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1261  cysteine desulphurase-like protein  33.08 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666075  normal  0.478253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.94 
 
 		 419 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.71 
 
 		 419 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.71 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0934  cysteine desulfurase family protein  32.69 
 
 		 395 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4075  cysteine desulfurase family protein  33.17 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000488918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.37 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.75 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  30.4 
 
 		 408 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.24 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.29 
 
 		 418 aa  176  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.54 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  31.16 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.33 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.12 
 
 		 404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.79 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.81 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  30.77 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  29.95 
 
 		 682 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.72 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.85 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.55 
 
 		 409 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  28.43 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  30.56 
 
 		 666 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.23 
 
 		 420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  31.06 
 
 		 423 aa  166  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3517  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.09 
 
 		 650 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1195  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.59 
 
 		 409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  30.56 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.69 
 
 		 429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.69 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.74 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.07 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.86 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.48 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.28 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  29.7 
 
 		 688 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  29.36 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4001  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.14 
 
 		 666 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.077192 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.18 
 
 		 572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  29.3 
 
 		 419 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  29.47 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3128  cysteine desulfurase family protein  34.31 
 
 		 414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000597393  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.19 
 
 		 416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  30.28 
 
 		 661 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  29.36 
 
 		 414 aa  163  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  28.14 
 
 		 412 aa  162  9e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  30.09 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.69 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  29.14 
 
 		 665 aa  162  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.43 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2890  cysteine desulphurase-like protein  31.86 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.74738  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2661  cysteine desulfurase  28.74 
 
 		 626 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0591977  normal  0.463261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  27.68 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.04 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.65 
 
 		 415 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  28.4 
 
 		 413 aa  160  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  30.14 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  28.27 
 
 		 405 aa  159  9e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  28.16 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.41 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  29.41 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.69 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  29.15 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.14 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  30.12 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.07 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  31.12 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.88 
 
 		 560 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  29.59 
 
 		 417 aa  156  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.44 
 
 		 413 aa  156  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  28.81 
 
 		 405 aa  156  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>