More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1472 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1472  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  100 
 
 		 401 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16930  putative pyridoxal-phosphate dependent enzyme  93.77 
 
 		 401 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00364141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3060  aminotransferase, class V  73.57 
 
 		 407 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.349128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  67.58 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  69.08 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1335  aminotransferase, class V  66.58 
 
 		 413 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.11336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4090  aminotransferase class V  68.83 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  67.58 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1092  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  67.67 
 
 		 430 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39100  cysteine desulfurase, sufS  72.32 
 
 		 449 aa  535  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0233253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  67.33 
 
 		 401 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.07 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.75 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.5 
 
 		 429 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  45.2 
 
 		 405 aa  358  8e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.5 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  43.58 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  43.83 
 
 		 405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.83 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.76 
 
 		 425 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.96 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.96 
 
 		 445 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.5 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.45 
 
 		 445 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.71 
 
 		 451 aa  349  4e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  46.37 
 
 		 415 aa  348  9e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.71 
 
 		 445 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.89 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  44.89 
 
 		 456 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.86 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.37 
 
 		 403 aa  345  8e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  45.86 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.61 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  46.72 
 
 		 405 aa  343  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 403 aa  342  9e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  42.82 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  42.82 
 
 		 406 aa  341  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  43.43 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  42.82 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  44.7 
 
 		 404 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  42.82 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  42.31 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.84 
 
 		 416 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.81 
 
 		 404 aa  339  4e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  42.82 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  42.82 
 
 		 406 aa  339  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0808  cysteine desulfurase  45.96 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  42.57 
 
 		 406 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.32 
 
 		 406 aa  338  9e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  44.47 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.47 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  46.04 
 
 		 409 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.3 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  42.57 
 
 		 406 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 406 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.33 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 572 aa  333  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.06 
 
 		 662 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.58 
 
 		 429 aa  332  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.69 
 
 		 406 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.09 
 
 		 406 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1894  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.13 
 
 		 630 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.84 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.15 
 
 		 408 aa  331  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  42.35 
 
 		 665 aa  329  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.04 
 
 		 657 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  41.69 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.84 
 
 		 406 aa  329  6e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  44.39 
 
 		 688 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  43.61 
 
 		 403 aa  328  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  44.02 
 
 		 682 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  43.83 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.06 
 
 		 412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.25 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.7 
 
 		 406 aa  327  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0753  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.36 
 
 		 420 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.21 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.08 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.42 
 
 		 413 aa  325  8.000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.83 
 
 		 419 aa  325  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.25 
 
 		 408 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.07 
 
 		 414 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  45.48 
 
 		 401 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.97 
 
 		 560 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  42.46 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  45.98 
 
 		 401 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.71 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  43.43 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3181  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  43.85 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.81 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.36 
 
 		 410 aa  322  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.39 
 
 		 404 aa  322  8e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.81 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  44.13 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  42.75 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>