More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3180 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  100 
 
 		 401 aa  822    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  72.07 
 
 		 401 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  73.07 
 
 		 401 aa  592  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  72.82 
 
 		 401 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  70.82 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 		 401 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 		 401 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  66.58 
 
 		 401 aa  544  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  66.08 
 
 		 401 aa  545  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 		 401 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  66.33 
 
 		 401 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  66.58 
 
 		 401 aa  544  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 		 401 aa  544  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  66.33 
 
 		 401 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  66.08 
 
 		 401 aa  541  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  66.33 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  66.08 
 
 		 401 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  65.09 
 
 		 401 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  65.09 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  65.09 
 
 		 401 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  65.09 
 
 		 401 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  64.84 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  53.48 
 
 		 404 aa  433  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  50.75 
 
 		 403 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  48.15 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  50.25 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.25 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  47.15 
 
 		 414 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.89 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.89 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.64 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.9 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  48 
 
 		 451 aa  359  4e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.89 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.54 
 
 		 418 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.5 
 
 		 408 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.28 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  42.18 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  45.27 
 
 		 404 aa  346  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.62 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.37 
 
 		 427 aa  344  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.8 
 
 		 420 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  45.12 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  42.54 
 
 		 405 aa  343  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  42.54 
 
 		 405 aa  343  2.9999999999999997e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.95 
 
 		 413 aa  343  4e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.64 
 
 		 605 aa  342  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.43 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  41.94 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.17 
 
 		 413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  44.25 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.67 
 
 		 662 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  46.12 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  40.1 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.22 
 
 		 413 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.61 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  44.69 
 
 		 413 aa  333  3e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.35 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.53 
 
 		 406 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.4 
 
 		 408 aa  332  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 414 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.23 
 
 		 417 aa  332  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.03 
 
 		 657 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.84 
 
 		 572 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.08 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  43.25 
 
 		 399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.83 
 
 		 407 aa  329  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.61 
 
 		 414 aa  329  6e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  40 
 
 		 569 aa  328  7e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  40.69 
 
 		 404 aa  328  8e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.25 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  41.94 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  42.96 
 
 		 604 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  42.96 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  42.96 
 
 		 604 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.25 
 
 		 420 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.45 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.55 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0199  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.02 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.98 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3637  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.11 
 
 		 678 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51832  normal  0.140258 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  41.69 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0124  cysteine desulphurases, SufS  42.79 
 
 		 688 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.3 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.96 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.65 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1552  cysteine desulphurases, SufS  42.54 
 
 		 682 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1527  cysteine sulfinate desulfinase  44.39 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  41.73 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.18 
 
 		 413 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  41.73 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.67 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.28 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 661 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.32 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.73 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.73 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>