More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2951 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02661  cysteine sulfinate desulfinase  99 
 
 		 401 aa  816    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0878  cysteine desulfurase, catalytic subunit CsdA  99 
 
 		 401 aa  816    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3310  cysteine sulfinate desulfinase  89.28 
 
 		 401 aa  731    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.04923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4075  cysteine sulfinate desulfinase  98.5 
 
 		 401 aa  813    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.023337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3130  cysteine sulfinate desulfinase  89.28 
 
 		 401 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00396808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3256  cysteine sulfinate desulfinase  83.54 
 
 		 401 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0902  cysteine sulfinate desulfinase  99 
 
 		 401 aa  816    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3210  cysteine sulfinate desulfinase  89.28 
 
 		 401 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0520726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2951  cysteine sulfinate desulfinase  100 
 
 		 401 aa  824    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00101745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02622  hypothetical protein  99 
 
 		 401 aa  816    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3147  cysteine sulfinate desulfinase  89.03 
 
 		 401 aa  714    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.148622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2954  cysteine sulfinate desulfinase  98.25 
 
 		 401 aa  812    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000519632  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3116  cysteine sulfinate desulfinase  99 
 
 		 401 aa  816    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000009707  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3195  cysteine sulfinate desulfinase  89.28 
 
 		 401 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.364366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3060  cysteine sulfinate desulfinase  98.25 
 
 		 401 aa  812    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000299944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3807  cysteine sulfinate desulfinase  71.82 
 
 		 401 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000833089  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0925  cysteine sulfinate desulfinase  70.57 
 
 		 401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.002092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3379  cysteine sulfinate desulfinase  70.32 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3222  cysteine sulfinate desulfinase  66.83 
 
 		 401 aa  561  1.0000000000000001e-159  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000462422  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0998  cysteine sulfinate desulfinase  67.08 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1050  cysteine sulfinate desulfinase  66.83 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3180  cysteine sulfinate desulfinase  66.58 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2996  cysteine sulfinate desulfinase  63.59 
 
 		 401 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  49.88 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  49.88 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  45.93 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  49.13 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.31 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.42 
 
 		 429 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0967  cysteine desulfurase, aminotransferase, class V  45.89 
 
 		 399 aa  348  7e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.42 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.42 
 
 		 420 aa  345  6e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.17 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.44 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.39 
 
 		 404 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  43.18 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.42 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43.16 
 
 		 425 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.3 
 
 		 417 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.46 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.36 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  43.18 
 
 		 413 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  41.69 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.11 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.87 
 
 		 425 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  40.62 
 
 		 569 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.81 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.79 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.86 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.75 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.64 
 
 		 662 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.34 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1516  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.18 
 
 		 406 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000472284  hitchhiker  0.000000602764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.94 
 
 		 664 aa  326  3e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769952 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1962  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.07 
 
 		 406 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00108569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.75 
 
 		 412 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.71 
 
 		 657 aa  325  6e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2915  cysteine desulfurase  42.97 
 
 		 404 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.297439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  40.55 
 
 		 405 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  43.64 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.18 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  40.8 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  43.64 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.28 
 
 		 406 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.85 
 
 		 416 aa  323  3e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.94 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.06 
 
 		 406 aa  322  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  43.66 
 
 		 414 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.29 
 
 		 417 aa  322  7e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  43.35 
 
 		 405 aa  322  7e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.33 
 
 		 674 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.33 
 
 		 672 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.21 
 
 		 414 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  42.2 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1236  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.98 
 
 		 413 aa  321  9.999999999999999e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1896  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000554851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.25 
 
 		 408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  42.21 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.68 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.53 
 
 		 406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01649  selenocysteine lyase  42.93 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000238093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01639  hypothetical protein  42.93 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000164024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1881  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.93 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000647321  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1761  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.93 
 
 		 406 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00014755  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.6 
 
 		 406 aa  319  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  43.39 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.64 
 
 		 413 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.44 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1951  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.68 
 
 		 406 aa  319  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00128399  unclonable  0.0000000107568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4090  aminotransferase class V  42.14 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.85 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.51 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.35 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.61 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.17 
 
 		 673 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.09 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.44 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.15 
 
 		 413 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.75 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.46 
 
 		 774 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>