More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2851 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2340  aminotransferase class V  98.1 
 
 		 421 aa  822    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0193219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2851  aminotransferase, class V  100 
 
 		 421 aa  839    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1794  cysteine desulfurase SufS  73.25 
 
 		 412 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.885674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0610  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1715  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.023757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2826  cysteine desulfurase SufS  72.75 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2763  cysteine desulfurase SufS  72.75 
 
 		 413 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2887  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2706  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.994563  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2402  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.34 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  43.31 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.62 
 
 		 415 aa  365  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.87 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.91 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  41.91 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.91 
 
 		 406 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 417 aa  355  6.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  44.12 
 
 		 414 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  41.91 
 
 		 406 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  41.91 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  41.91 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.67 
 
 		 406 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  43.84 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  41.91 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  41.91 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  41.91 
 
 		 406 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.15 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.5 
 
 		 408 aa  352  5e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.13 
 
 		 406 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.59 
 
 		 451 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.34 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.17 
 
 		 416 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.73 
 
 		 413 aa  350  3e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.85 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  41.42 
 
 		 405 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  44.09 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.85 
 
 		 429 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.83 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.73 
 
 		 412 aa  345  7e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  41.23 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.12 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  43.87 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.48 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.44 
 
 		 404 aa  343  4e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.79 
 
 		 409 aa  343  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.3 
 
 		 421 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  41.29 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.95 
 
 		 412 aa  340  4e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  43.32 
 
 		 405 aa  339  7e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.64 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.34 
 
 		 421 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  41.18 
 
 		 403 aa  337  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.94 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  42.86 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  42.86 
 
 		 604 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.8 
 
 		 408 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.39 
 
 		 407 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  47.3 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  38.78 
 
 		 413 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.74 
 
 		 410 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.42 
 
 		 419 aa  334  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.1 
 
 		 407 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 444 aa  332  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.33 
 
 		 412 aa  332  9e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.57 
 
 		 414 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.83 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  41.34 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  44.55 
 
 		 405 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.28 
 
 		 435 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.73 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  44.07 
 
 		 409 aa  330  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.73 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  43.38 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  38.93 
 
 		 410 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.45 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.1 
 
 		 420 aa  329  6e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  41.35 
 
 		 414 aa  329  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  41.35 
 
 		 414 aa  328  9e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.06 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  38.05 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.47 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  42.24 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  44.66 
 
 		 429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.93 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.25 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  43.86 
 
 		 661 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.77 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  37.96 
 
 		 410 aa  326  6e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.94 
 
 		 403 aa  326  6e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  38.96 
 
 		 405 aa  325  9e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  39.21 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.49 
 
 		 641 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.82 
 
 		 605 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.79 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  44.92 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>