More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2340 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2340  aminotransferase class V  100 
 
 		 421 aa  840    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0193219  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2851  aminotransferase, class V  98.1 
 
 		 421 aa  822    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1794  cysteine desulfurase SufS  73 
 
 		 412 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.885674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2763  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2826  cysteine desulfurase SufS  72.5 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0610  cysteine desulfurase SufS  72.25 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2706  cysteine desulfurase SufS  72.25 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.994563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2887  cysteine desulfurase SufS  72.25 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1715  cysteine desulfurase SufS  72.25 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.023757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2402  cysteine desulfurase SufS  72.25 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.61 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  42.82 
 
 		 419 aa  360  2e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.38 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.33 
 
 		 404 aa  355  8.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.66 
 
 		 415 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.39 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.9 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  41.18 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  41.18 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  41.18 
 
 		 406 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.93 
 
 		 406 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.38 
 
 		 414 aa  349  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  41.18 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  41.18 
 
 		 406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  41.18 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  41.18 
 
 		 406 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.1 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  43.35 
 
 		 404 aa  348  1e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.61 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.34 
 
 		 451 aa  347  2e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.39 
 
 		 406 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.68 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.77 
 
 		 408 aa  347  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.61 
 
 		 429 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  43.35 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.99 
 
 		 406 aa  342  8e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  40 
 
 		 413 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  40 
 
 		 413 aa  341  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.85 
 
 		 418 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  40.93 
 
 		 405 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.3 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.09 
 
 		 429 aa  338  7e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.3 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  40.74 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.73 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  43.14 
 
 		 404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.45 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.08 
 
 		 414 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.69 
 
 		 404 aa  335  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.39 
 
 		 407 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1637  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.85 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  40.55 
 
 		 412 aa  333  2e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  42.57 
 
 		 405 aa  333  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  43.14 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.25 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.2 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  41.89 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  41.89 
 
 		 604 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.37 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  39.3 
 
 		 408 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0655  hypothetical protein  41.11 
 
 		 414 aa  328  7e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  46.81 
 
 		 417 aa  329  7e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  38.97 
 
 		 412 aa  329  7e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0639  hypothetical protein  41.11 
 
 		 414 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  40.2 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.83 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3674  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.68 
 
 		 419 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  38.05 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.07 
 
 		 414 aa  326  5e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  40.84 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.1 
 
 		 412 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.91 
 
 		 414 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  44.17 
 
 		 429 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.55 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.72 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.56 
 
 		 406 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2439  SufS subfamily cysteine desulfurase  46 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2484  SufS subfamily cysteine desulfurase  46 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.585611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  41.77 
 
 		 422 aa  322  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  43.81 
 
 		 405 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.3 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.56 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.03 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  42.65 
 
 		 403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  39.38 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.9 
 
 		 414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2475  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.52 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.659693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.85 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  37.96 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.07 
 
 		 605 aa  320  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  43.1 
 
 		 409 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2622  cysteine desulphurases, SufS  41.83 
 
 		 666 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.44 
 
 		 403 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0023  putative cysteine desulfurase  43.11 
 
 		 661 aa  319  6e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.493291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2736  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.74 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.69 
 
 		 403 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13380  cysteine desulfurase  44.21 
 
 		 441 aa  318  7.999999999999999e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0605361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.07 
 
 		 433 aa  318  7.999999999999999e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>