More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2763 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2706  cysteine desulfurase SufS  99.76 
 
 
413 aa  821    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.994563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0610  cysteine desulfurase SufS  99.76 
 
 
413 aa  820    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2826  cysteine desulfurase SufS  99.76 
 
 
413 aa  818    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2763  cysteine desulfurase SufS  100 
 
 
413 aa  821    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1794  cysteine desulfurase SufS  91.28 
 
 
412 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.885674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1715  cysteine desulfurase SufS  99.76 
 
 
413 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.023757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2402  cysteine desulfurase SufS  99.76 
 
 
413 aa  820    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2887  cysteine desulfurase SufS  99.76 
 
 
413 aa  820    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2851  aminotransferase, class V  72.75 
 
 
421 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2340  aminotransferase class V  72.5 
 
 
421 aa  543  1e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0193219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.29 
 
 
406 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.61 
 
 
404 aa  363  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.16 
 
 
406 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  43.28 
 
 
404 aa  358  9e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  43.25 
 
 
419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.36 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.26 
 
 
418 aa  356  5e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.86 
 
 
408 aa  355  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  41.12 
 
 
406 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.36 
 
 
408 aa  352  7e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.87 
 
 
451 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.75 
 
 
406 aa  351  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  40.61 
 
 
406 aa  349  4e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.15 
 
 
416 aa  350  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  40.61 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  40.61 
 
 
406 aa  349  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  43 
 
 
420 aa  349  6e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.28 
 
 
421 aa  348  7e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.07 
 
 
429 aa  348  7e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.36 
 
 
412 aa  348  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.12 
 
 
429 aa  348  8e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  44.55 
 
 
405 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.12 
 
 
429 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  42.25 
 
 
415 aa  345  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.12 
 
 
429 aa  345  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.86 
 
 
414 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.54 
 
 
412 aa  344  2e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.1 
 
 
406 aa  343  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  42.46 
 
 
403 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  44.25 
 
 
405 aa  342  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0604  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
409 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.542169  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  40.36 
 
 
408 aa  342  7e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  43.86 
 
 
420 aa  342  9e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.5 
 
 
410 aa  342  9e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  40.58 
 
 
408 aa  341  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  41.1 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  41 
 
 
405 aa  339  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  43.36 
 
 
414 aa  338  8e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  43.47 
 
 
403 aa  338  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.29 
 
 
421 aa  338  9e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.47 
 
 
425 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  43.72 
 
 
412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.5 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.5 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  39.81 
 
 
410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21000  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  44.9 
 
 
604 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16690  Cysteine desulfurase, SufS-like protein  44.9 
 
 
604 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.11 
 
 
419 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  40.99 
 
 
404 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  44.08 
 
 
404 aa  333  2e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  46.62 
 
 
429 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  40.86 
 
 
410 aa  333  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.5 
 
 
414 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  42.16 
 
 
444 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  41.4 
 
 
417 aa  332  6e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.53 
 
 
418 aa  332  7.000000000000001e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  44.92 
 
 
422 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.8 
 
 
413 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  40 
 
 
413 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.32 
 
 
433 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  40.64 
 
 
405 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2493  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.36 
 
 
605 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.07 
 
 
413 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.61 
 
 
407 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11492  cysteine desulfurase csd  49.75 
 
 
417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0542664  normal  0.287952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  41.1 
 
 
412 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  39.9 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.22 
 
 
412 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5792  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.25 
 
 
641 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  40.75 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.61 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  40.75 
 
 
405 aa  327  3e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.41 
 
 
427 aa  325  8.000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  42 
 
 
414 aa  325  9e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.61 
 
 
406 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  42 
 
 
414 aa  325  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.61 
 
 
406 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.61 
 
 
406 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01976  cysteine desulfurase  42.61 
 
 
414 aa  324  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  39.5 
 
 
404 aa  324  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  44.62 
 
 
408 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.36 
 
 
406 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1969  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  42.36 
 
 
406 aa  323  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0908482  hitchhiker  0.0000000737026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.7 
 
 
657 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>