More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3570 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3570  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 294 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.111769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3258  30S ribosomal protein S1  73.95 
 
 		 278 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686673  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2850  RNA binding S1 domain protein  37.04 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000968936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2968  Ribosomal protein S1-like protein  38.55 
 
 		 500 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1477  RNA binding S1 domain-containing protein  38.55 
 
 		 480 aa  158  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.22973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1960  RNA binding S1 domain protein  39.27 
 
 		 492 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12990  30S ribosomal protein S1  43.89 
 
 		 492 aa  155  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.927286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3198  RNA binding S1 domain protein  38.91 
 
 		 488 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565242  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1089  30S ribosomal protein S1  38.91 
 
 		 515 aa  155  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0119116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1804  30S ribosomal protein S1  38.91 
 
 		 491 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000161597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2065  30S ribosomal protein S1  38.91 
 
 		 491 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11140  30S ribosomal protein S1  44.02 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2435  RNA binding S1 domain protein  42.15 
 
 		 499 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2193  30S ribosomal protein S1  38.55 
 
 		 488 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5522  30S ribosomal protein S1  44.5 
 
 		 495 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2989  30S ribosomal protein S1  42.29 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0790572  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25930  30S ribosomal protein S1  44.98 
 
 		 495 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20190  SSU ribosomal protein S1P  38.55 
 
 		 496 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1229  30S ribosomal protein S1  38.55 
 
 		 488 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.964467  normal  0.190984 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3020  30S ribosomal protein S1  41.7 
 
 		 479 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156856  normal  0.0844361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3005  30S ribosomal protein S1  41.7 
 
 		 479 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2872  RNA binding S1 domain protein  42.15 
 
 		 487 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1515  RNA binding S1 domain protein  38.91 
 
 		 490 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.906108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3051  30S ribosomal protein S1  41.7 
 
 		 479 aa  153  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1057  30S ribosomal protein S1  38.35 
 
 		 492 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5672  30S ribosomal protein S1  38.18 
 
 		 493 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1191  30S ribosomal protein S1  38.91 
 
 		 485 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00406916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5494  30S ribosomal protein S1  38.55 
 
 		 493 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0961  RNA binding S1 domain protein  38.55 
 
 		 496 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3356  30S ribosomal protein S1  42.58 
 
 		 481 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0698685  normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3561  30S ribosomal protein S1  42.58 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0469219  normal  0.360425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11646  30S ribosomal protein S1  41.26 
 
 		 481 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3034  30S ribosomal protein S1  37.82 
 
 		 485 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000095518  hitchhiker  0.00573325 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14990  30S ribosomal protein S1  43.06 
 
 		 493 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0409109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2948  30S ribosomal protein S1  44.02 
 
 		 505 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.188906 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1079  RNA binding S1 domain protein  39.91 
 
 		 427 aa  145  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0601  30S ribosomal protein S1  39.83 
 
 		 500 aa  144  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0745  30S ribosomal protein S1  41.9 
 
 		 491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.146171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2523  RNA binding S1 domain protein  35.14 
 
 		 405 aa  138  8.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05300  SSU ribosomal protein S1P  34.42 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.467971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3140  30S ribosomal protein S1  44.5 
 
 		 493 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3369  30S ribosomal protein S1  44.5 
 
 		 493 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.412554  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2872  RNA binding S1 domain protein  44.91 
 
 		 529 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.569342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0117  RNA binding S1 domain protein  33.7 
 
 		 598 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  31.27 
 
 		 574 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0962  RNA binding S1 domain protein  33.7 
 
 		 418 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.331059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  31.76 
 
 		 584 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  31.76 
 
 		 584 aa  125  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  30.97 
 
 		 584 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 576 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 576 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4287  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.01 
 
 		 393 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000310337  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0934  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.01 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000731277  normal  0.167396 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 576 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 576 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 570 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 589 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2015  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.71 
 
 		 411 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0652883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 577 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  31.8 
 
 		 571 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3767  RNA binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 507 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0768989  normal  0.0130256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  31.27 
 
 		 573 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0964  30S ribosomal protein S1  32.51 
 
 		 562 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0110  RNA binding S1 domain-containing protein  32.6 
 
 		 558 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000433742  normal  0.284586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  29.73 
 
 		 586 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1350  RNA binding S1 domain protein  34.5 
 
 		 431 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  31.45 
 
 		 562 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2244  30S ribosomal protein S1  32.84 
 
 		 571 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.777167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  31.45 
 
 		 562 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1795  SSU ribosomal protein S1P  32.74 
 
 		 539 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  31.45 
 
 		 562 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  32.09 
 
 		 564 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  32.09 
 
 		 564 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1112  RNA binding S1 domain protein  37.07 
 
 		 397 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000019918  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  31 
 
 		 559 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  36.67 
 
 		 569 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  36.67 
 
 		 569 aa  118  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0694  RNA binding S1 domain protein  28.9 
 
 		 554 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  32.87 
 
 		 558 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19980  SSU ribosomal protein S1P  32.97 
 
 		 407 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10450  4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl diphosphate reductase  33.68 
 
 		 678 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000887819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1437  RNA binding S1 domain protein  33.33 
 
 		 400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.245145  normal  0.159598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2469  30S ribosomal protein S1  30.99 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.327946  normal  0.369216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  30.99 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1730  RNA-binding S1 domain-containing protein  30.77 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0218599  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1027  RNA binding S1 domain protein  32.06 
 
 		 504 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000173139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3285  30S ribosomal protein S1  30.99 
 
 		 561 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00279338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  32 
 
 		 567 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  28.89 
 
 		 596 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  27.24 
 
 		 720 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>