More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0694 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0694  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 554 aa  1119    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  34.59 
 
 		 577 aa  332  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2080  cytidylate kinase/ribosomal protein S1  32.32 
 
 		 811 aa  325  1e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1292  ribosomal protein S1  35.79 
 
 		 720 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  33.4 
 
 		 577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4661  SSU ribosomal protein S1P  32.66 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0143658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0995  30S ribosomal protein S1  34.1 
 
 		 584 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3255  30S ribosomal protein S1  34.1 
 
 		 584 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000271492  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2860  ribosomal protein S1  32.83 
 
 		 557 aa  316  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  33.21 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1350  ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2301  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 578 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 573 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1176  RNA binding S1 domain protein  34.86 
 
 		 644 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1467  30S ribosomal protein S1  34.1 
 
 		 584 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000364254  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0147  30S ribosomal protein S1  33.33 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000164989  normal  0.503273 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1620  ribosomal protein S1  36.42 
 
 		 597 aa  311  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2603  30S ribosomal protein S1  33.92 
 
 		 574 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00445858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2118  ribosomal protein S1  32.07 
 
 		 596 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000596679  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2333  30S ribosomal protein S1  33.58 
 
 		 570 aa  310  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000922659  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1520  30S ribosomal protein S1  33.78 
 
 		 568 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2435  30S ribosomal protein S1  33.78 
 
 		 568 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2347  30S ribosomal protein S1  33.78 
 
 		 568 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.139373  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2963  30S ribosomal protein S1  33.65 
 
 		 593 aa  309  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000174303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0867  30S ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 586 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314961  normal  0.0879612 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1981  ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 604 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000204813  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  35.25 
 
 		 564 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  35.15 
 
 		 564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0570  30S ribosomal protein S1  32.97 
 
 		 592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0452  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000961926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2335  30S ribosomal protein S1  33.27 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00568908  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  36.05 
 
 		 570 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  35.08 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2000  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 591 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000749746  normal  0.10797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0247  ribosomal protein S1  34.11 
 
 		 562 aa  303  7.000000000000001e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  35.77 
 
 		 570 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  35.51 
 
 		 567 aa  302  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  35.77 
 
 		 576 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  35.77 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  34.96 
 
 		 561 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  35.77 
 
 		 576 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1794  30S ribosomal protein S1  33.09 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000217401  normal  0.053041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  35.69 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1297  30S ribosomal protein S1  33.79 
 
 		 599 aa  301  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  35.58 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  35.42 
 
 		 576 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  34.67 
 
 		 562 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  34.48 
 
 		 562 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  34.29 
 
 		 558 aa  301  3e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  34.48 
 
 		 562 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5663  RNA binding S1 domain protein  32.3 
 
 		 595 aa  300  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  35.71 
 
 		 589 aa  300  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  34.57 
 
 		 555 aa  299  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 569 aa  299  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 569 aa  299  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  34.55 
 
 		 560 aa  299  9e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1413  30S ribosomal protein S1  33.15 
 
 		 555 aa  299  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0578612  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2311  30S ribosomal protein S1  34.25 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000015623  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  35.51 
 
 		 571 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 555 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  33.02 
 
 		 557 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2069  30S ribosomal protein S1  35.99 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000607618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  35.51 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0418  30S ribosomal protein S1  32.34 
 
 		 591 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000167097  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0373  30S ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 570 aa  297  3e-79  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0107492  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1376  30S ribosomal protein S1  34.46 
 
 		 558 aa  297  3e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  34.57 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  34.57 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  34.57 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  34.16 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  33.46 
 
 		 556 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  34.35 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  34.57 
 
 		 555 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1372  30S ribosomal protein S1  34.27 
 
 		 558 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  34.38 
 
 		 555 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0956  30S ribosomal protein S1  35.6 
 
 		 573 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000014577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0129  30S ribosomal protein S1  32.6 
 
 		 586 aa  295  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00811703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1732  30S ribosomal protein S1  32.9 
 
 		 589 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000125222  decreased coverage  0.00441133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  33.78 
 
 		 560 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2382  ribosomal protein S1  34.22 
 
 		 608 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1280  30S ribosomal protein S1  35.12 
 
 		 559 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  34.11 
 
 		 555 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10333  30S ribosomal protein S1  32.11 
 
 		 619 aa  292  9e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.869439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2762  30S ribosomal protein S1  33.2 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.841821  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00915  30S ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2209  30S ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000110592  normal  0.604495 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2685  30S ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000435893  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  33.27 
 
 		 556 aa  290  4e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1017  30S ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000848151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1008  30S ribosomal protein S1  34.64 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000383759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>