More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4326 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4326  epimerase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4479  epimerase  99.61 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.882429  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4296  epimerase  98.82 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4411  epimerase  99.61 
 
 
254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0676156  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4409  epimerase  99.61 
 
 
254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0057  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.3 
 
 
236 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00297659  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1747  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.16 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000490404  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0469  Ribulose-phosphate 3-epimerase  30.29 
 
 
221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0536  Ribulose-phosphate 3-epimerase  28.57 
 
 
221 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2484  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.33 
 
 
220 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1858  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.98 
 
 
230 aa  107  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.84 
 
 
218 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1739  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.01 
 
 
227 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.178471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1537  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.77 
 
 
222 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0651  Ribulose-phosphate 3-epimerase  28.7 
 
 
221 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1649  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.56 
 
 
221 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  27.7 
 
 
221 aa  103  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0532  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  29.09 
 
 
221 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.266071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5429  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.55 
 
 
227 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1951  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.5 
 
 
229 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.19 
 
 
218 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2125  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.44 
 
 
225 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00642843 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.18 
 
 
231 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.48 
 
 
217 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.71 
 
 
219 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.48 
 
 
217 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2572  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.84 
 
 
244 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.712481  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2292  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.99 
 
 
227 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1507  Ribulose-phosphate 3-epimerase  25.78 
 
 
220 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0082  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.58 
 
 
228 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2395  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.86 
 
 
221 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1957  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.2 
 
 
225 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2419  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.53 
 
 
225 aa  99.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.23 
 
 
219 aa  99.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.03 
 
 
219 aa  99.4  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0287  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.84 
 
 
232 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.86 
 
 
209 aa  99.4  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.69 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1918  Ribulose-phosphate 3-epimerase  32 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.301545  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32100  predicted protein  29.67 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0416889  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1941  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  29.47 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3710  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  31 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0845805 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0049  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  27.03 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.54 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5109  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.2 
 
 
215 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0277689  normal  0.123014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.54 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1664  ribulose-phosphate 3-epimerase  32.6 
 
 
232 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00014027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0576  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  28.71 
 
 
220 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.885825  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.58 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1489  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.84 
 
 
226 aa  96.3  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0453865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0447  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.22 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423262  normal  0.174808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3128  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.18 
 
 
223 aa  95.9  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0842  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.7 
 
 
225 aa  95.9  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  29.21 
 
 
224 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  28.71 
 
 
224 aa  95.5  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0712  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.19 
 
 
225 aa  95.5  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1776  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.45 
 
 
220 aa  95.5  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0850  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.57 
 
 
225 aa  95.1  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1342  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  28.71 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.361236 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4780  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.41 
 
 
221 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0175  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.7 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0104  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  28.5 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2376  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.28 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3842  Ribulose-phosphate 3-epimerase  30.69 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0107323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0790  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  30.04 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.93 
 
 
221 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.22 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0501  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.51 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1996  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.82 
 
 
238 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.78 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1167  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  28.31 
 
 
217 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000257786  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0022  ribulose-phosphate 3-epimerase  30.69 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0827  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.05 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.31 
 
 
214 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5270  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.11 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.12238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2606  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.57 
 
 
236 aa  93.2  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.203389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2590  ribulose-phosphate 3-epimerase  29.47 
 
 
234 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0691249  normal  0.0209735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0914  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  34.08 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000393455  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3251  ketose-bisphosphate aldolase class-II  28 
 
 
224 aa  92.4  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1488  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.6 
 
 
215 aa  92  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0454  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  30.81 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0801863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2864  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  31.16 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  27.12 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1430  ribulose-phosphate 3-epimerase  31.16 
 
 
236 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0977  Ribulose-phosphate 3-epimerase  27.98 
 
 
219 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.213833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4675  ribulose-phosphate 3-epimerase  28.12 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2632  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  30.1 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0005  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  30.7 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.8 
 
 
211 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0333  ribulose-phosphate 3-epimerase  26.57 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.540612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0167  ribulose-phosphate 3-epimerase  27.23 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>