More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3195 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3195  major facilitator transporter  100 
 
 		 445 aa  845    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2962  major facilitator transporter  84.53 
 
 		 462 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2964  major facilitator transporter  82.5 
 
 		 464 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.413021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2971  major facilitator transporter  82.45 
 
 		 445 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.828936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  41.04 
 
 		 444 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.65 
 
 		 522 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.15 
 
 		 502 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.72 
 
 		 458 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.16 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.61 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.89 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  31.24 
 
 		 467 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.4 
 
 		 498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 		 528 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 494 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 		 504 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 		 478 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.81 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.54 
 
 		 458 aa  160  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.97 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0599  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  30.23 
 
 		 511 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  29.94 
 
 		 492 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 463 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.53 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0909  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2216  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.762949 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.42 
 
 		 524 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.33 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.51 
 
 		 510 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.15 
 
 		 540 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 461 aa  155  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.2 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.82 
 
 		 502 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5690  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0856329 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.16 
 
 		 763 aa  153  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.5 
 
 		 474 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.85 
 
 		 478 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.91 
 
 		 488 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.13 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.02 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 453 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 487 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.49 
 
 		 524 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.56 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 478 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 506 aa  150  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.64 
 
 		 521 aa  149  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.44 
 
 		 520 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.82 
 
 		 488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.58 
 
 		 516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.5 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.15 
 
 		 583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  29.22 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.35 
 
 		 506 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  29.18 
 
 		 534 aa  147  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.02 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 468 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 466 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34 
 
 		 475 aa  146  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.47 
 
 		 607 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.99 
 
 		 489 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.22 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.42 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 579 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  25.4 
 
 		 526 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.42 
 
 		 514 aa  144  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 500 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 507 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.65 
 
 		 522 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 509 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.12 
 
 		 506 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  32.65 
 
 		 502 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>