More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0781 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0781  peptide deformylase  100 
 
 		 162 aa  329  9e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1299  peptide deformylase  64.2 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.596527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1274  peptide deformylase  64.2 
 
 		 162 aa  221  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  36.54 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  37.34 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  35.9 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  36.13 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2519  peptide deformylase  36.94 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000745148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  34.19 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  33.54 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  34.42 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  36.91 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  36.31 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3910  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3608  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3626  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0022378  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3915  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4005  peptide deformylase  35.67 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  39.44 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  37.42 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1713  peptide deformylase  31.33 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  34.27 
 
 		 187 aa  94  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  33.8 
 
 		 187 aa  94  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  32.47 
 
 		 154 aa  93.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1277  peptide deformylase  34.39 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  34.97 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  33.11 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3966  peptide deformylase  33.76 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  33.56 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  36.03 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1885  polypeptide deformylase  38.78 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.366875  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  33.55 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1604  polypeptide deformylase  38.78 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000418701  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  34.27 
 
 		 147 aa  90.9  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  37.06 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3475  peptide deformylase  34.94 
 
 		 185 aa  90.9  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000032021  decreased coverage  0.000233702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  31.72 
 
 		 186 aa  90.9  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  33.81 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  35.66 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1052  peptide deformylase  33.73 
 
 		 185 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.771095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4385  peptide deformylase  35.03 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.699073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  35.62 
 
 		 172 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  36.05 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  32.52 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  34.88 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  32.52 
 
 		 171 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  33.56 
 
 		 150 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  33.55 
 
 		 177 aa  87.8  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1778  peptide deformylase  34.59 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.818545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  31.03 
 
 		 186 aa  87.8  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  31.61 
 
 		 154 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  30.34 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  33.56 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2486  peptide deformylase  32.91 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.176168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2534  polypeptide deformylase  33.97 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  34.31 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  35.86 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  31.03 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1032  peptide deformylase  30.19 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.209609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0542  peptide deformylase  34.25 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  31.85 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2092  peptide deformylase  31.37 
 
 		 165 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  34.48 
 
 		 185 aa  85.1  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2070  peptide deformylase  30.19 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  30.82 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  30.82 
 
 		 187 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  30.41 
 
 		 181 aa  84.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  31.29 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  35.17 
 
 		 185 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3146  peptide deformylase  34.01 
 
 		 171 aa  84.3  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107781  normal  0.346577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  32.47 
 
 		 183 aa  84  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3565  peptide deformylase  34.07 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  30.94 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  32.19 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0454  peptide deformylase  33.33 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  32.19 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  31.51 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  34.48 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  27.54 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  34.51 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  31.51 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  32.19 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0906  peptide deformylase  33.76 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000931901 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1204  peptide deformylase  30.3 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  28.47 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0632  peptide deformylase  32.19 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  30.14 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  30.67 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  31.51 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0095  peptide deformylase  30.14 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  35.61 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3513  peptide deformylase  31.82 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.145382  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  30.07 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  30.6 
 
 		 183 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  27.78 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  31.21 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>