191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3338 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 388 aa  780    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  36.57 
 
 		 378 aa  216  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  33.53 
 
 		 373 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  34.99 
 
 		 390 aa  212  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  34.82 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  33.24 
 
 		 389 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  33.7 
 
 		 389 aa  203  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  32.99 
 
 		 405 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  32.65 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  32.65 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  34.44 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  33.43 
 
 		 388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  33.43 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  34.74 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  33.77 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  33.23 
 
 		 396 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  31.96 
 
 		 416 aa  176  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 398 aa  176  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  31.39 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  28.1 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  30.29 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  30.23 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  29.94 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  30.46 
 
 		 376 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  28.78 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  30.46 
 
 		 376 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  30.42 
 
 		 376 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  30.14 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  30.64 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  28.78 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.62 
 
 		 379 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  30.34 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  28.46 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  30.66 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.48 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.79 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  28.79 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  28.4 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.83 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  27.85 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  26.58 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 		 792 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.9 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  23.49 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  23.2 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  25.46 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  26.13 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  25.12 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  30.91 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  30.91 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  30.91 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0593  permease-like protein  25.97 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.472296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  29.93 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.55 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  27.16 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  23.26 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  27.78 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 363 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  28.18 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  25.54 
 
 		 340 aa  56.2  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  23.76 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  28.18 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  27.39 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  23.71 
 
 		 357 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  24.05 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.07 
 
 		 369 aa  52.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  24.02 
 
 		 341 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  26.67 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>