More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1922 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  835    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  40 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  39.95 
 
 		 389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  40.32 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  36.95 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  37.53 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  37.97 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  38.75 
 
 		 379 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  32.07 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  32.58 
 
 		 391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  32.57 
 
 		 379 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  28.23 
 
 		 792 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  32.38 
 
 		 380 aa  153  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  31.82 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  29.79 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  32.33 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  31.6 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.17 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  27.66 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  31.23 
 
 		 371 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  30.91 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 391 aa  121  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  30.48 
 
 		 371 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  31.3 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 370 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 434 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  26.3 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.71 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.72 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 370 aa  106  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  28.1 
 
 		 1040 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  27.42 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 370 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  25.54 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  25 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  26.65 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.67 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  27.83 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  28.29 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  23.9 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  25.9 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.2 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25.45 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  27.69 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 370 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  27.71 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  28.48 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  28.76 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  27.58 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  28.71 
 
 		 388 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  25.85 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  25.36 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  23.63 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  23.46 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  25.81 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 1061 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  27.04 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  24.31 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  28.46 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  25.85 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 1061 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  26.08 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  20.81 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  26.73 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  26.34 
 
 		 370 aa  89.7  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.85 
 
 		 401 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  25.55 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 441 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.47 
 
 		 384 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.84 
 
 		 1153 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  24.02 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  25.81 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>