More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3752 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 388 aa  785    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  68.98 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  68.98 
 
 		 393 aa  521  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  53.83 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  55.91 
 
 		 391 aa  441  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  53.23 
 
 		 391 aa  431  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  47.85 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  47.1 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  48.12 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  45.65 
 
 		 434 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  41.42 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  41.29 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  38.44 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  40.26 
 
 		 403 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  37.5 
 
 		 401 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  37.47 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  38.54 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  36.66 
 
 		 400 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  38.68 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  38.68 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  35.86 
 
 		 386 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  32.62 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  31.3 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 1061 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 1061 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.6 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.67 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 1040 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.34 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 792 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  24.28 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.37 
 
 		 442 aa  96.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 441 aa  96.3  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  22.02 
 
 		 442 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  20.41 
 
 		 443 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 379 aa  93.2  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 387 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.22 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 1111 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  25.68 
 
 		 352 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 444 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 1153 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.59 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.04 
 
 		 359 aa  86.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.38 
 
 		 1096 aa  86.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  22.69 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 394 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.64 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.26 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  20.64 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.29 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  19.95 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.32 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  23.44 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  28.63 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  19.79 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  20.69 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.05 
 
 		 366 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  24.18 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  26.53 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  22.93 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 		 377 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  23.62 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 364 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  31.93 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>