144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1043 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  756    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0837  hypothetical protein  24.07 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00840057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 389 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.31 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.79 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  23.34 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.54 
 
 		 418 aa  93.6  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 382 aa  86.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.33 
 
 		 364 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 1061 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.39 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  20.21 
 
 		 792 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 		 1040 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.8 
 
 		 1061 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.79 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.16 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  22.78 
 
 		 651 aa  64.3  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 1096 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  23.71 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.23 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  23.71 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  25.77 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  19.42 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  20.51 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  20.63 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.88 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.56 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  35.63 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.96 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  38.67 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.11 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.74 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  22.11 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 498 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  20.72 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.97 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 1153 aa  53.9  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  20.19 
 
 		 443 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  18.08 
 
 		 481 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.33 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.64 
 
 		 501 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  20.52 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  20.57 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  19.26 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  19.73 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  19.39 
 
 		 370 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  26.92 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  19.48 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  19.48 
 
 		 376 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 		 378 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  18.38 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.33 
 
 		 356 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  19.3 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  19.53 
 
 		 1111 aa  50.4  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  19.11 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  18.94 
 
 		 371 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  22.95 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  19.35 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  17.75 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  21.27 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  19.67 
 
 		 394 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 442 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.19 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  24.44 
 
 		 356 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  22.62 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  20.78 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  19.77 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 357 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.93 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  22.22 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>