158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0157 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 1111 aa  2246    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 1096 aa  591  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  40.24 
 
 		 1061 aa  464  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  40.07 
 
 		 1061 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  35.83 
 
 		 1153 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.61 
 
 		 1040 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 364 aa  151  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 356 aa  100  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 356 aa  97.8  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 387 aa  92  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 388 aa  92  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  25.77 
 
 		 357 aa  91.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 389 aa  89.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 		 365 aa  89.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 		 395 aa  88.2  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 391 aa  88.2  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  25.2 
 
 		 360 aa  87  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  20.39 
 
 		 360 aa  87  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 395 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.99 
 
 		 392 aa  85.9  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.33 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 360 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  20.17 
 
 		 360 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.37 
 
 		 434 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.55 
 
 		 401 aa  81.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.93 
 
 		 384 aa  80.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  19.69 
 
 		 418 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 358 aa  80.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  20.44 
 
 		 359 aa  79  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.59 
 
 		 359 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.89 
 
 		 359 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 382 aa  74.3  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.68 
 
 		 401 aa  73.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 393 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 393 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  19.18 
 
 		 358 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  18.93 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 380 aa  72  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.64 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  18.93 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  22.16 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 346 aa  70.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  25.08 
 
 		 386 aa  70.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  18.94 
 
 		 359 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 359 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  19.1 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  19.89 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  21.94 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.89 
 
 		 364 aa  67.8  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 		 389 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  20.56 
 
 		 361 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.48 
 
 		 792 aa  66.6  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.93 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.67 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.6 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.42 
 
 		 394 aa  64.7  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  19.06 
 
 		 399 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 358 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 360 aa  63.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 360 aa  63.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 388 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 391 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  20.4 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  19.89 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  21.73 
 
 		 394 aa  60.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 409 aa  60.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 358 aa  60.1  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  21.79 
 
 		 359 aa  60.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 369 aa  60.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  19.74 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  23.75 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.23 
 
 		 371 aa  57.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 423 aa  57.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  30.86 
 
 		 230 aa  57.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  20.45 
 
 		 417 aa  57  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  20.21 
 
 		 392 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21 
 
 		 386 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.4 
 
 		 403 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  20.66 
 
 		 359 aa  57  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  23.13 
 
 		 346 aa  56.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.17 
 
 		 357 aa  55.8  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 362 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  20.13 
 
 		 358 aa  55.1  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  22.5 
 
 		 396 aa  54.7  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 		 362 aa  54.3  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>