224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1814 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 371 aa  734    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  47.97 
 
 		 376 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  47.7 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  48.24 
 
 		 376 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  45.05 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  40.11 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  40.12 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  30.32 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  28.45 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  28.52 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.67 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  28.94 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  27.62 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  26.41 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  27.62 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  29.47 
 
 		 389 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 398 aa  115  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  29.53 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  29.53 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  26.41 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  27.42 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  27.36 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  28.66 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  28.76 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 		 388 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 		 402 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  24.12 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  24.22 
 
 		 402 aa  95.9  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  24.22 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 393 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  26.78 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  23.31 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  27.02 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  28.88 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  29.43 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  26.03 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  25.88 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  26.29 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  24.9 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  34.4 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 1111 aa  62.8  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  32.65 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  26.25 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  22.78 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  36 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  24.31 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.24 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  24.88 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  24.2 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  25.17 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.31 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 389 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  27.74 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.32 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  35.29 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  29.35 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.52 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.52 
 
 		 383 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  30.36 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  27.78 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  22.69 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  26.83 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 		 371 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.66 
 
 		 380 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  31.58 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.83 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  23.72 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  26.45 
 
 		 360 aa  53.1  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.56 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.83 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  26.28 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  25.85 
 
 		 360 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  30.87 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  29.59 
 
 		 375 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.52 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  26.28 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  19.56 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 369 aa  52.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  25.23 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  25.81 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  25.81 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>