More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3735 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 359 aa  729    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  57.26 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  56.7 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  58.61 
 
 		 360 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  57.22 
 
 		 360 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  45.38 
 
 		 359 aa  328  8e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  43.58 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  35.65 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  30.55 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  28.81 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.78 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.47 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  25.42 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.25 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 		 356 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.46 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 1040 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.74 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 374 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.42 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 395 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.44 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.6 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 352 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 352 aa  95.9  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 		 434 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  22.79 
 
 		 358 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.25 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 352 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.43 
 
 		 392 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  21.31 
 
 		 356 aa  93.2  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.56 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.16 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 382 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.84 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.5 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 361 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.88 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.39 
 
 		 1061 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.62 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  22.22 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.59 
 
 		 394 aa  88.6  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.11 
 
 		 1061 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  21.83 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  21.31 
 
 		 356 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  25.21 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.43 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 367 aa  87  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.43 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.69 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.62 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  21.08 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  22.25 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.65 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  22.32 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 1096 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  22.19 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  22.39 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  22.09 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.68 
 
 		 400 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.86 
 
 		 391 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  22.6 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  21.54 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 396 aa  77  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>