157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3417 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 402 aa  798    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  40.17 
 
 		 409 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  33.8 
 
 		 396 aa  156  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  28.93 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  37.8 
 
 		 230 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  30.03 
 
 		 418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  27.4 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  27.42 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  28.09 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  29.43 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.13 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.29 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  26.36 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  23.57 
 
 		 1111 aa  73.6  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.78 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.45 
 
 		 1153 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  26.67 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  22.4 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.45 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  22.4 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  27.19 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  27.19 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.81 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  26.08 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 393 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  31.15 
 
 		 495 aa  67  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  22.27 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  26.09 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  22.88 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  25.93 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  28.76 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  27.05 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  20.58 
 
 		 1096 aa  63.2  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  22.91 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.87 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  25.7 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.27 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  22.1 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  26.13 
 
 		 483 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  23.53 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25.82 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  20.65 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  24.35 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  20.05 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.82 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.8 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  22.54 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 792 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  26.13 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.89 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  26.14 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 480 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.95 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  18.38 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  21.2 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  22.28 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.7 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  26.11 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  19.36 
 
 		 1061 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  20.38 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 372 aa  53.1  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  19.36 
 
 		 1061 aa  53.5  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  23.47 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  19.67 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  34 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  34 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>