More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1431 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 391 aa  791    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  34.55 
 
 		 389 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  33.15 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  33.52 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  32.9 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  32.89 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 		 382 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  33.06 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  34.02 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  32.58 
 
 		 418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  34.29 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  31.72 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  35.37 
 
 		 392 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  34.13 
 
 		 395 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.58 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 391 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 388 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  28.12 
 
 		 389 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.67 
 
 		 792 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  28.89 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25.4 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  25.4 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 356 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  29.57 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.61 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  27.93 
 
 		 371 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 434 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  27.93 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 444 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.23 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.67 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.54 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 1040 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.41 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.44 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  26.37 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.16 
 
 		 1153 aa  99.8  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1043  hypothetical protein  24.92 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0296445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 1061 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 1061 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  24.73 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.32 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.61 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.47 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  28.09 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.58 
 
 		 359 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  26.45 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  22.87 
 
 		 358 aa  90.1  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.23 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  26.77 
 
 		 443 aa  89  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.82 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  26.08 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 1111 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  26.99 
 
 		 395 aa  86.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.34 
 
 		 358 aa  86.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  26.09 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  49.38 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  27.25 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  26.47 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  26.19 
 
 		 388 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  28.92 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 1096 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  24.21 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  20.64 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  26.1 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  25.29 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  22.71 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  23.89 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 481 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  19.84 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.87 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  25.09 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.51 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>