More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1923 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  723    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  73.26 
 
 		 359 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  57.26 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  50.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  50.97 
 
 		 360 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  45.51 
 
 		 359 aa  352  7e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  48.18 
 
 		 359 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  36.44 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  33.14 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.86 
 
 		 792 aa  150  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  27.69 
 
 		 365 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  27.76 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 371 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.65 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  25.93 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 360 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  28.45 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  27.72 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  26.45 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  25.5 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 391 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  27.08 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  27.33 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  26.65 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  25.32 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  25.19 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 382 aa  105  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.58 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  25.79 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  23.86 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.21 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  24.16 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  26.26 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  24.36 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  28.7 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  27.98 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  27.98 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  27.67 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  28.37 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 369 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  23.94 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  23.7 
 
 		 356 aa  99.8  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  26.33 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 1040 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.63 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  25.97 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  26.24 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  23.56 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  23.12 
 
 		 355 aa  96.7  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  26.48 
 
 		 360 aa  96.3  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 352 aa  96.3  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  23.71 
 
 		 353 aa  96.3  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  23.55 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  21.63 
 
 		 355 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  23.43 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  26.91 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.16 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.67 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  24.79 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  23.16 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  26.05 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  26.05 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  26.05 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.8 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.08 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  26.05 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.54 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  26.05 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>