245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2021 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 369 aa  746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  25.58 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  26.7 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  25.64 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.1 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 792 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.27 
 
 		 362 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.65 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 359 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.97 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.99 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.39 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  21.58 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.35 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 1061 aa  82.8  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.76 
 
 		 386 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.35 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 1061 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  19.5 
 
 		 1096 aa  80.1  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 		 387 aa  79.3  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  20.88 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  24.12 
 
 		 1040 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.03 
 
 		 403 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  25.51 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  19.46 
 
 		 1153 aa  75.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  21.41 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 1111 aa  73.2  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.34 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  23.84 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  22.16 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  21.99 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.11 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  23.58 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  20.81 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  21.85 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.47 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.1 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  26.04 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.35 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  24.87 
 
 		 368 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.76 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  32.31 
 
 		 501 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1230  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.494831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  19.26 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  19.53 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  25.23 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  22.36 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  20.38 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.96 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  24.73 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  21.17 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  20.56 
 
 		 387 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.48 
 
 		 483 aa  57  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  23.57 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  20.42 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  23.08 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  21.48 
 
 		 358 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  23.9 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.84 
 
 		 403 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  19.93 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  24.39 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.54 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  24.39 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>