164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1510 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 396 aa  815    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.13 
 
 		 359 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.19 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.4 
 
 		 360 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 		 362 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  23.81 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.71 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.07 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.33 
 
 		 359 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.56 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00860  hypothetical protein  25.2 
 
 		 359 aa  88.2  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.09 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.65 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.59 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.54 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 792 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.31 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.2 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.51 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.73 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  19.33 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  20.71 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.18 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.34 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  23.02 
 
 		 359 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.68 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  20.49 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  19.39 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  19.3 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  23.34 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  23.34 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  20.7 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.5 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  24.22 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 365 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  20.59 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  22.02 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.7 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.96 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.4 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.35 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  19.63 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.3 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 1040 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  22.4 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  20.83 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  20.65 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  19.35 
 
 		 442 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.33 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  21.56 
 
 		 365 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  21.78 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  21.88 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  21.56 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  23.38 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  23.5 
 
 		 370 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  18.75 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  22.05 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.74 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.17 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  21.07 
 
 		 355 aa  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  20.21 
 
 		 356 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  24.66 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  18.38 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  19.74 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  21.43 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  19.95 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  23.04 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>