192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1949 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  100 
 
 		 359 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  53.91 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  55.18 
 
 		 361 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  44.54 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  46.22 
 
 		 360 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.5 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 360 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.28 
 
 		 362 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.45 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.21 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 356 aa  97.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  29.14 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.78 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  26.65 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  26.36 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  27.42 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.53 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 1040 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  23.87 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  23.02 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.01 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.94 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  20.29 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  24.44 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.98 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.1 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  18.62 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.1 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  24.59 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  24.59 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.35 
 
 		 367 aa  62.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  20.52 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.47 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.51 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  21.9 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.13 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.78 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.8 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  22.66 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  20.28 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  20.48 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  21.48 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  20.96 
 
 		 1153 aa  56.6  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  19.2 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.14 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  23.71 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  21.01 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  20.14 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  20.54 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  23.69 
 
 		 364 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  22.97 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  23.03 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 363 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  22.41 
 
 		 370 aa  53.5  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  20.1 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  20.1 
 
 		 359 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>