211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0148 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
364 aa  728    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  32.57 
 
 
1040 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  29.59 
 
 
1061 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  29.29 
 
 
1061 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  28.08 
 
 
1096 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 
1153 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  29.6 
 
 
1111 aa  159  7e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  26.11 
 
 
356 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.55 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  26.4 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.46 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 
434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  26.38 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.4 
 
 
392 aa  113  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 
403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.2 
 
 
394 aa  109  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 
365 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.84 
 
 
399 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 
391 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 
393 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 
393 aa  106  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 
382 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 
417 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 
391 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2733  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 
360 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.193527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 
395 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 
395 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 
391 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 
389 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  25.68 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 
364 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  27.71 
 
 
418 aa  92.8  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.34 
 
 
401 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  22.85 
 
 
401 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.75 
 
 
374 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  24.86 
 
 
395 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.52 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
792 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.15 
 
 
358 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  21.39 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.27 
 
 
400 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.11 
 
 
401 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.34 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25.12 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.42 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.88 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 
346 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.04 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  20.39 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4679  permease YjgP/YjgQ family protein  23.77 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.1 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  20.99 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  24.3 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  23 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2956  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.199366  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.98 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  21.34 
 
 
371 aa  69.7  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  21.53 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  22.32 
 
 
357 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.19 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.13 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  23.62 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.26 
 
 
380 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  22.26 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.75 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  22.26 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  25.46 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  20.44 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  20.64 
 
 
386 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  22.56 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  24.45 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  22.94 
 
 
483 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 
478 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  20.57 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  22.57 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 
359 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 
371 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  22.52 
 
 
379 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  19.01 
 
 
358 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0685  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000242264  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  19.94 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 
359 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  20.82 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  18.92 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>