206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2743 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 367 aa  739    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  40.11 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  39.34 
 
 		 358 aa  232  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  39.43 
 
 		 357 aa  229  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  36.45 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  36.75 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  36.45 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  36.45 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  36.45 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  32.84 
 
 		 381 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  31.74 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  31.04 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  31.78 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  28.49 
 
 		 372 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  29.68 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  29.95 
 
 		 375 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  28.49 
 
 		 372 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  28.24 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  27.37 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  27.73 
 
 		 370 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  28.65 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  28.65 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  28.65 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.36 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 371 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  29.41 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  27.11 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  27.41 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  27.41 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  27.88 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  29.02 
 
 		 372 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.05 
 
 		 370 aa  132  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  28.07 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.92 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  28.16 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  27.17 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  28.96 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  26.18 
 
 		 388 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  27.38 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  28.22 
 
 		 366 aa  126  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  26.2 
 
 		 360 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.45 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  28.23 
 
 		 372 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  27.68 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  28.76 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 370 aa  119  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  25.21 
 
 		 370 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  27.08 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  31.08 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  28.72 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  26.33 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.75 
 
 		 360 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  24.84 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  25.21 
 
 		 365 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  24.86 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  24.86 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  24.86 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  24.86 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  24.86 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  24.86 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  28.89 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  27.54 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  24.53 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  24.57 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  26.29 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 372 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  27.64 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 370 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  23.34 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 365 aa  99.8  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  25.23 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  27.93 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  28.66 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>