171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2786 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
360 aa  705    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  52.23 
 
 
360 aa  358  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  43.09 
 
 
361 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  45.25 
 
 
364 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  44.17 
 
 
365 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  44.17 
 
 
365 aa  309  5e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  44.97 
 
 
363 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  44.69 
 
 
363 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  45.81 
 
 
364 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  44.41 
 
 
365 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  45.81 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  44.69 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  45.81 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  43.3 
 
 
370 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  45.25 
 
 
363 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  44.85 
 
 
359 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  39.67 
 
 
371 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  43.75 
 
 
372 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  43.47 
 
 
372 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  38.02 
 
 
371 aa  279  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  44.76 
 
 
372 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  41.14 
 
 
372 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  40.46 
 
 
373 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  37.46 
 
 
376 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  42.15 
 
 
363 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  36.14 
 
 
373 aa  229  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  37.36 
 
 
373 aa  222  7e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  36.36 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  35.65 
 
 
364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  35.47 
 
 
379 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  36.12 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  36.94 
 
 
372 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  36.12 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  34.86 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  32.73 
 
 
366 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  31.34 
 
 
366 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  31.41 
 
 
366 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  32.56 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  33.63 
 
 
381 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  30.9 
 
 
375 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  30.9 
 
 
375 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  32.75 
 
 
367 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  31.25 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  30.16 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  33.63 
 
 
367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  30.89 
 
 
373 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  31.61 
 
 
358 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 
371 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 
371 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 
383 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  31.38 
 
 
371 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  30.68 
 
 
372 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  28.9 
 
 
368 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  34.72 
 
 
372 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  29.07 
 
 
366 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  29.71 
 
 
370 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 
370 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  28.86 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  29.15 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  29.12 
 
 
370 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  31.95 
 
 
339 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  32.96 
 
 
386 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 
372 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  28.33 
 
 
371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  34.55 
 
 
372 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.83 
 
 
370 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  30.61 
 
 
370 aa  146  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  29.83 
 
 
370 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  31.78 
 
 
376 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  29.55 
 
 
370 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  29.55 
 
 
370 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 
370 aa  142  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  31.53 
 
 
370 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  27.78 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  27.52 
 
 
371 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  28.57 
 
 
370 aa  133  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  27.22 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  29.5 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 
367 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  32.36 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  27.5 
 
 
359 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  29.91 
 
 
367 aa  123  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  26.2 
 
 
359 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  29 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  29 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  29 
 
 
364 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  29.05 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.07 
 
 
360 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 
369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  28.28 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  28.28 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  28.28 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  28.28 
 
 
366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>