159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3163 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 365 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  75.49 
 
 		 363 aa  474  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  72.13 
 
 		 372 aa  475  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  74.79 
 
 		 363 aa  475  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  67.13 
 
 		 375 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  60.28 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  59.77 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  56.82 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  54.49 
 
 		 373 aa  378  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  50.41 
 
 		 363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  47.25 
 
 		 364 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  38.02 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  37.13 
 
 		 363 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  37.91 
 
 		 364 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  37.12 
 
 		 363 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  37.78 
 
 		 372 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  37.69 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  37.69 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  37.69 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  37.69 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  37.69 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  37.69 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  37.22 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  37.69 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  36.7 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  36.7 
 
 		 364 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  37.39 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  34.52 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  36.72 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  36.39 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  35.82 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  35.22 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  34.59 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  34.66 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  34.57 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  34.38 
 
 		 373 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  35.22 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  30.28 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  34.93 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  34.48 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  29.09 
 
 		 367 aa  142  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  30.93 
 
 		 367 aa  136  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  29.1 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.17 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.47 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 371 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  26.92 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  26.13 
 
 		 339 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  25.62 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  27.53 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  26.2 
 
 		 373 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  25.6 
 
 		 383 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  28.05 
 
 		 369 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  25.52 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25.14 
 
 		 369 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  28.8 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  30.61 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  27.12 
 
 		 370 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  26.84 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  27.17 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  25.99 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  29.74 
 
 		 367 aa  102  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  27.04 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  26.88 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  26.61 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  27.51 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  27.67 
 
 		 386 aa  99.4  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  21.41 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 370 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0537  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613487  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  24.49 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.45 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  26.01 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 370 aa  95.9  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 371 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  21.47 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.16 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  27.16 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  27.16 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  23.99 
 
 		 388 aa  90.5  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  22.8 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  24.83 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  25 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  25 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  22.25 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>