164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2170 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 373 aa  749    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  83.52 
 
 		 376 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  58.52 
 
 		 373 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  58.09 
 
 		 379 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  51.36 
 
 		 375 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  54.49 
 
 		 365 aa  358  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  54.47 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  54.47 
 
 		 363 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  53.74 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  48.06 
 
 		 363 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  43.73 
 
 		 364 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  38.75 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  38.92 
 
 		 364 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  39.52 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  39.49 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  40.46 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  42.68 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  40.11 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  40.11 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  40.11 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  40.11 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  40.11 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  40.11 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  40.11 
 
 		 365 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  40.11 
 
 		 365 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  39.51 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  39.26 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  39.1 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  38.81 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  39.14 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  39.14 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  38.84 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  41.28 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  36.83 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  38.21 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  35.5 
 
 		 360 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  36.39 
 
 		 371 aa  233  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  34 
 
 		 361 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  36.19 
 
 		 360 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  33.52 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  30.86 
 
 		 367 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  28.24 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  25.74 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  30.84 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  27.2 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  25.36 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  27.53 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  28.06 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  29.06 
 
 		 372 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.4 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.15 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.39 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  27.13 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  26.07 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  28.62 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  28.04 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 372 aa  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  27.62 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.8 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.41 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  26.98 
 
 		 388 aa  99.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  24.78 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  25.8 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 370 aa  99  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  26.76 
 
 		 366 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  25.89 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  25.78 
 
 		 370 aa  96.3  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 370 aa  96.3  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 367 aa  96.3  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 370 aa  96.3  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  26.11 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  27.15 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  24.27 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  27.6 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  27.6 
 
 		 370 aa  90.5  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  25 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  26.41 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 		 366 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  25.43 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  27.65 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.32 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  21.31 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0537  permease YjgP/YjgQ family protein  28.03 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613487  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  21.58 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0099  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>