183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0622 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  86.25 
 
 		 371 aa  662    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 371 aa  743    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  55.74 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  55.18 
 
 		 372 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  51.52 
 
 		 372 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  54.62 
 
 		 372 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  50 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  50.82 
 
 		 373 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  50 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  50.28 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  50.28 
 
 		 364 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  50.28 
 
 		 363 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  50.56 
 
 		 370 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  50.84 
 
 		 365 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  50.84 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  49.44 
 
 		 363 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  51.21 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  51.21 
 
 		 364 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  51.21 
 
 		 363 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  50.91 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  42.58 
 
 		 360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  40.51 
 
 		 361 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  39.67 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  38.07 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  38.79 
 
 		 375 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  36.97 
 
 		 373 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  38.08 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  36.99 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  36.14 
 
 		 365 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  36.25 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  35.22 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  37.43 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  35.54 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  35.54 
 
 		 363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  37.23 
 
 		 363 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  31.64 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  31.02 
 
 		 339 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  31.46 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  31.99 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  31.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  31.74 
 
 		 370 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  32.55 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  31.9 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  29.94 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  29.78 
 
 		 375 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  31.13 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  30.08 
 
 		 375 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  33.82 
 
 		 367 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  30.73 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  30.42 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  29.55 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  29.66 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.94 
 
 		 370 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  29.63 
 
 		 371 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  31.27 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  29.21 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  29.8 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  29.38 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  31.25 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 371 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 		 370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  28.37 
 
 		 359 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  29.34 
 
 		 372 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  29.06 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  30.68 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  30.61 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  29.23 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  29.06 
 
 		 366 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  30.08 
 
 		 366 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  27.62 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  31.01 
 
 		 386 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  30.14 
 
 		 368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.51 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  29.17 
 
 		 372 aa  146  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  29.79 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  31.78 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  31.46 
 
 		 371 aa  144  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  30.43 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  30.43 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  30.43 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  30.43 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  30.72 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  30.43 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  30.43 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  30.14 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  29.5 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  29.51 
 
 		 371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.5 
 
 		 360 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  30.22 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  30.22 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  30.22 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>