295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0402 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 
358 aa  723    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  38.75 
 
 
367 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  34.31 
 
 
363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  33.24 
 
 
357 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  35.31 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  35.31 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  35.31 
 
 
356 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  35.01 
 
 
356 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  35.01 
 
 
356 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  35.01 
 
 
356 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  30.56 
 
 
381 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  31 
 
 
372 aa  139  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  29.91 
 
 
372 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  30.88 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  27.89 
 
 
368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  28.25 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  28.25 
 
 
370 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  28.9 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  27.97 
 
 
370 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  29.94 
 
 
370 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  30.51 
 
 
370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  26.18 
 
 
369 aa  126  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  28.22 
 
 
373 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  29.33 
 
 
370 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  27.52 
 
 
375 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.05 
 
 
367 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  28.07 
 
 
370 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  28.61 
 
 
366 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  30.28 
 
 
339 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  29.1 
 
 
370 aa  123  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  27.25 
 
 
375 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.58 
 
 
372 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  29.1 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  29.1 
 
 
370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  28.12 
 
 
369 aa  119  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  29.1 
 
 
370 aa  119  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  25.34 
 
 
361 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  29.08 
 
 
372 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  27.98 
 
 
388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  26.29 
 
 
371 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  27.11 
 
 
360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  27.07 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  26.13 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  28.19 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  27.2 
 
 
370 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 
371 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  29.31 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 
371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  27.43 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 
371 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  25.16 
 
 
364 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 
383 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  26.85 
 
 
359 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 
364 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 
364 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  25.47 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  25 
 
 
365 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 
367 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  24.63 
 
 
365 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 
370 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  25.74 
 
 
358 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  26.07 
 
 
366 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 
371 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 
363 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 
363 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  24.69 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  24.69 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  24.69 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  24.69 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  24.69 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  24.69 
 
 
365 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  25.54 
 
 
365 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  24.84 
 
 
364 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 
371 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  26.3 
 
 
359 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 
370 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  26.58 
 
 
373 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  25.23 
 
 
365 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  25.68 
 
 
372 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  27.08 
 
 
372 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  26.63 
 
 
366 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 
372 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  27 
 
 
373 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  25.38 
 
 
375 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  28.69 
 
 
359 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 
370 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 
372 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 
365 aa  95.9  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 
363 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  26.13 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  23.75 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.24 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  24.25 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  24.25 
 
 
364 aa  90.1  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  25.13 
 
 
366 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  25.13 
 
 
366 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  25.13 
 
 
366 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>