213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2114 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 386 aa  751    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  48.06 
 
 		 367 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  36.44 
 
 		 372 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  36.44 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  34.44 
 
 		 373 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  34.44 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  35.19 
 
 		 371 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  35.21 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  35.21 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  33.06 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  34.31 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  33.14 
 
 		 360 aa  188  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  36.95 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  31.39 
 
 		 361 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  33.15 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  37.36 
 
 		 372 aa  176  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  33.63 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  32.44 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  33.24 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  32.37 
 
 		 371 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  34.71 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  32.93 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  33.24 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  32.54 
 
 		 370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  30.45 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  26.93 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  32.37 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  31.79 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  31.79 
 
 		 364 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  31.79 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  31.37 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  31.9 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  31.11 
 
 		 365 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  26.65 
 
 		 359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  30.56 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 364 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  29.86 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  32.37 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  32.37 
 
 		 370 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  31.01 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  30.77 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  30.77 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  30.77 
 
 		 365 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  31.67 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  32.37 
 
 		 370 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  34.87 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  30.94 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  32.08 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  30.87 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.74 
 
 		 371 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  29.81 
 
 		 365 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  30.17 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  32.74 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  30.98 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  32.19 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  32.56 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  31.58 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.88 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  28.66 
 
 		 372 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  29.73 
 
 		 372 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  28.83 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  35.43 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  28.83 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  32.96 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  28.83 
 
 		 372 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  35.04 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  28.21 
 
 		 369 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  31.38 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  26.89 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  27.33 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  30.91 
 
 		 373 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  26.15 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  25.57 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  27.89 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  29.39 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  28.99 
 
 		 371 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  30.12 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24.2 
 
 		 366 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  32.51 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  32.22 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  27.55 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  31.09 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  27.03 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  28.66 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02661  putative permease, YjgP/YjgQ family  29.69 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  28.33 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  32.2 
 
 		 363 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  32.2 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2200  YjgP/YjgQ family protein  28.57 
 
 		 373 aa  99.4  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.395164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>