250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0680 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 372 aa  718    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  53.85 
 
 		 372 aa  330  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  39.46 
 
 		 367 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  37.8 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  36.16 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  40.06 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  40.06 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  38.6 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  39.77 
 
 		 371 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  36.95 
 
 		 370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  37.35 
 
 		 367 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  37.11 
 
 		 375 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  37.76 
 
 		 370 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  36.55 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  35.88 
 
 		 372 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  35.5 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  38.55 
 
 		 386 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  34.5 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  35.78 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  41.23 
 
 		 372 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  35.78 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  35.48 
 
 		 370 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  35.78 
 
 		 370 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  35.36 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  31.3 
 
 		 366 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  34.91 
 
 		 370 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  34.97 
 
 		 370 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  33.71 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  31.7 
 
 		 366 aa  192  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  35.33 
 
 		 372 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  30.47 
 
 		 361 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  39 
 
 		 376 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  35.73 
 
 		 370 aa  192  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  33.43 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  31.75 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  32.26 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  35.19 
 
 		 363 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  34.68 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  32.01 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  34.2 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  34.91 
 
 		 371 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  34.85 
 
 		 360 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  34.39 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  34.6 
 
 		 370 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  32.92 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  33.52 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  30.49 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  30.66 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  31.78 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  30.62 
 
 		 365 aa  169  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  30.66 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  31.86 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  30.08 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  30.08 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  30.08 
 
 		 365 aa  169  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  32.38 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  31.42 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  30 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  30.86 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02661  putative permease, YjgP/YjgQ family  35.91 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0537  permease YjgP/YjgQ family protein  36.71 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613487  normal  0.97553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  29.43 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  28.65 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  32.48 
 
 		 370 aa  162  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 371 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  30.86 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  30.05 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  30.57 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  29.5 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 371 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  32.01 
 
 		 357 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  29.5 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  29.5 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  26.87 
 
 		 369 aa  155  8e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  29.19 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  32.31 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  30.83 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  31.91 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  32.14 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  32.14 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  32.14 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  34.87 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4008  permease YjgP/YjgQ family protein  27.84 
 
 		 371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  34.72 
 
 		 360 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1142  putative permease  32.73 
 
 		 370 aa  139  7e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0875  hypothetical membrane spanning protein  32.12 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  28.05 
 
 		 367 aa  132  7.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0563  permease YjgP/YjgQ family protein  31.46 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000298554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  27.3 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0099  permease YjgP/YjgQ family protein  34.87 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  29.19 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  29.19 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  29.19 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  29.19 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  29.19 
 
 		 366 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>