171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5798 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2384  permease YjgP/YjgQ family protein  95.87 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  85.08 
 
 		 365 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  85.08 
 
 		 365 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5798  YjgP/YjgQ like transporter  100 
 
 		 363 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.159259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0827  permease YjgP/YjgQ family protein  94.51 
 
 		 364 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  85.36 
 
 		 365 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1856  permease YjgP/YjgQ  95.88 
 
 		 364 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2516  permease YjgP/YjgQ family protein  96.14 
 
 		 363 aa  688    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2467  permease YjgP/YjgQ family protein  96.15 
 
 		 364 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2340  hypothetical protein  85.08 
 
 		 365 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2945  hypothetical protein  85.08 
 
 		 365 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  84.81 
 
 		 365 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1021  hypothetical protein  85.08 
 
 		 365 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1654  hypothetical protein  85.08 
 
 		 365 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.398552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2472  permease YjgP/YjgQ family protein  96.15 
 
 		 364 aa  682    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3639  membrane protein, YjgP/YjgQ like  86.19 
 
 		 365 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  86.19 
 
 		 365 aa  624  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2226  permease YjgP/YjgQ family protein  85.04 
 
 		 370 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  51.43 
 
 		 372 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  51.14 
 
 		 372 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  50 
 
 		 372 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  49.16 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  50.57 
 
 		 372 aa  355  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  50.28 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  49.05 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  42.58 
 
 		 360 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  39.88 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  37.25 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  44.69 
 
 		 360 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  39.33 
 
 		 373 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  40.06 
 
 		 373 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  39.14 
 
 		 379 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  37.71 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  38.11 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  37.75 
 
 		 364 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1943  putative transmembrane protein  38.92 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.729281  normal  0.0884093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  38.23 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  36.23 
 
 		 372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  38.02 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  38.02 
 
 		 363 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  32.77 
 
 		 375 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  31.75 
 
 		 375 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  32.84 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  30.81 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  30.41 
 
 		 372 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 		 371 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  31.96 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  31.79 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  30.59 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  30.68 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  30.95 
 
 		 372 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  32.55 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  33.04 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  30.7 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  28.94 
 
 		 381 aa  163  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  30.45 
 
 		 386 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  30 
 
 		 372 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  27.62 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  27.35 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  30.11 
 
 		 370 aa  149  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  29.28 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  31.53 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  27.35 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  30.23 
 
 		 386 aa  146  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  29.81 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  29.56 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  29.56 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  29.83 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  26.63 
 
 		 359 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  28.69 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  30.75 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  26.35 
 
 		 359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  29.01 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  29.91 
 
 		 370 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  28.53 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  29.26 
 
 		 366 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  29.65 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  31.12 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  28.02 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  28.24 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  28.24 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  28.82 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  29.7 
 
 		 371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  32.08 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  32.08 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  32.08 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  32.08 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  32.08 
 
 		 366 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  27.9 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  31.54 
 
 		 366 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  30.62 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  30.62 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  30.62 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  30.62 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  30.62 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  30.62 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  30.62 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>