179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3265 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02856  conserved hypothetical protein  99.16 
 
 		 356 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000121999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3265  YjgP/YjgQ permease  100 
 
 		 356 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.342085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0713  permease YjgP/YjgQ family protein  99.16 
 
 		 356 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3160  YjgP/YjgQ permease  98.88 
 
 		 356 aa  716    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3447  YjgP/YjgQ permease  98.88 
 
 		 356 aa  717    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02805  hypothetical protein  99.16 
 
 		 356 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000010354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44330  permease YjgP/YjgQ family  52.66 
 
 		 357 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2743  permease YjgP/YjgQ family protein  36.75 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.731454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  34.65 
 
 		 358 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  34.22 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  28.49 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  33.03 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  29.75 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  29.71 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  29.46 
 
 		 372 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  30.3 
 
 		 372 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  27.53 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.58 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  26.69 
 
 		 366 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  28 
 
 		 360 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  29.81 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 371 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  25.67 
 
 		 370 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  29.81 
 
 		 371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  29.81 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  26.74 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  28.66 
 
 		 375 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  24.71 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  30.06 
 
 		 373 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  23.67 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  24 
 
 		 366 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  24.93 
 
 		 359 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1369  hypothetical protein  25.14 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2826  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00420336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3005  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000818676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  25.44 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1179  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.301073  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  27.73 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  24.71 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  24.09 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2908  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000409785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  23.65 
 
 		 369 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  23.96 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  22.63 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3526  permease YjgP/YjgQ family protein  29.68 
 
 		 372 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.536872  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4048  hypothetical protein  26.58 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000983322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3542  putative permease  26.58 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000328546  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0053  permease YjgP/YjgQ  24.22 
 
 		 428 aa  95.9  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0622  permease YjgP/YjgQ family protein  25.87 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0271293  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2114  permease YjgP/YjgQ family protein  27.88 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.774642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  24.39 
 
 		 370 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  26.17 
 
 		 370 aa  89.4  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  26.81 
 
 		 367 aa  88.6  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4923  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 372 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  25.08 
 
 		 360 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3647  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 		 366 aa  86.7  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000993409  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2596  permease YjgP/YjgQ family protein  28.9 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0445451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1724  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1920  permease YjgP/YjgQ family protein  26.6 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.960962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3163  permease YjgP/YjgQ family protein  26.88 
 
 		 365 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0045  hypothetical protein  23.32 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.402941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2416  hypothetical protein  24.75 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  29.48 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2220  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 372 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2680  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2729  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3736  permease YjgP/YjgQ family protein  29.1 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2808  permease YjgP/YjgQ  23.1 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.94667  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  27.61 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  27.61 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  27.61 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  27.61 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  25.16 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  27.61 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0822  permease, putative  23.97 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3538  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2684  permease YjgP/YjgQ  24.76 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1014  hypothetical protein  24.15 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.146018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0671  permease, putative  24.15 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1174  permease, putative  24.15 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>