161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2345 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2345  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 346 aa  665    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  71.68 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  41.16 
 
 		 367 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 1040 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 1096 aa  96.3  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1044  hypothetical protein  23.22 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000929765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  22.43 
 
 		 1111 aa  90.9  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.11 
 
 		 1061 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 		 1061 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  24.52 
 
 		 418 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  27.55 
 
 		 391 aa  86.3  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  27.24 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 382 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.66 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  24.14 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  25.61 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0048  permease YjgP/YjgQ  27.07 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 1153 aa  77  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 		 792 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  27.93 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  24.23 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  30.89 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.75 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  28.14 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.39 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.96 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  23.22 
 
 		 400 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.82 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.36 
 
 		 399 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 384 aa  69.3  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.63 
 
 		 363 aa  69.3  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.79 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  21.51 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.56 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.64 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.24 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.87 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  22.89 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  22.43 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  25.75 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1247  permease  23.28 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  22.43 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  28.25 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 444 aa  62  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 478 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  29.61 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  26.42 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  24.66 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  27.68 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.3 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  20.95 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  26.71 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  25.49 
 
 		 373 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  21.02 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.56 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.77 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  26.18 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  25.88 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.03 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.37 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  23.51 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.62 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.34 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.91 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.13 
 
 		 356 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  28.02 
 
 		 370 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  26.62 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 358 aa  52.8  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  28.78 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  25 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  19.07 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  25.17 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 392 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 369 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>