151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0375 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 361 aa  715    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  64.43 
 
 		 360 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  55.18 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  45.94 
 
 		 358 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  44.97 
 
 		 360 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  27.84 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  27.3 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  23.69 
 
 		 360 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  28.2 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.93 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.5 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  27.01 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  25.86 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.59 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.27 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.98 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.88 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.47 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.44 
 
 		 1040 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  21.19 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  26.47 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  23.9 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  23.94 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  25.55 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.28 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.66 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  24.86 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  29.12 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  27.25 
 
 		 360 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  23.06 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.45 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  24.93 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  21.98 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.73 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  25.41 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  26.69 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.12 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.14 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  26.78 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.87 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.59 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  25.49 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  23.05 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  19.77 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  24.11 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.23 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  23.31 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  18.96 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  24.44 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  23.61 
 
 		 362 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  23.96 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  20.36 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  23.61 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  20.63 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  23.92 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  25.35 
 
 		 386 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 362 aa  53.1  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  24.88 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  25.35 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  22.3 
 
 		 356 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 1153 aa  52.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  25.76 
 
 		 353 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  24.26 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  22.3 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  26.24 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  23.63 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  23.23 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  23.23 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  22.55 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>