198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2209 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
377 aa  738    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  52.91 
 
 
378 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1183  permease YjgP/YjgQ  32.28 
 
 
381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.807963  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 
382 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  27.2 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  27.57 
 
 
360 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  26.06 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  24.27 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.93 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.87 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.31 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 
388 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 
434 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.78 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  25.39 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 
374 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.22 
 
 
1040 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.97 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.06 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  27.15 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.4 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.71 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  25.52 
 
 
359 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  36.8 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  27.81 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.63 
 
 
418 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  21.46 
 
 
391 aa  72  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  21.55 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.54 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.73 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 
360 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  19.42 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.99 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.43 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.27 
 
 
792 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  24.49 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  28.79 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.06 
 
 
417 aa  66.2  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.58 
 
 
418 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.09 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  21.93 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  23.63 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  23.01 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 
360 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 
361 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.28 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  23.16 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.3 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  32.03 
 
 
388 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  26.7 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  31.82 
 
 
481 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0049  permease YjgP/YjgQ  28.33 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  31.33 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  21.68 
 
 
1111 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  20.57 
 
 
401 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  29.41 
 
 
395 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  29.22 
 
 
388 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  26.61 
 
 
346 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  21.37 
 
 
401 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  33.86 
 
 
443 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  22.66 
 
 
403 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  28.27 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 
1153 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  29.41 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  28.27 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  29.38 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  28.15 
 
 
498 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  25.59 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  33.08 
 
 
354 aa  57  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 
359 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2021  permease YjgP/YjgQ family protein  25.45 
 
 
369 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 
358 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  32.97 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.4 
 
 
384 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 
1061 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 
359 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 
367 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.99 
 
 
501 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  29.03 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  31.5 
 
 
495 aa  54.7  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  28.87 
 
 
388 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  28.8 
 
 
394 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  33.6 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  37.21 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 
1061 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  23.85 
 
 
366 aa  53.9  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>