161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1297 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 358 aa  720    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  44.54 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  44.82 
 
 		 360 aa  317  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  45.94 
 
 		 361 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  46.47 
 
 		 360 aa  295  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  29.95 
 
 		 359 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 360 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  26.12 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.64 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.1 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.84 
 
 		 360 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 359 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 365 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.87 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.51 
 
 		 359 aa  92.8  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  21.25 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  23.88 
 
 		 1040 aa  83.2  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  22.7 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  24.12 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  22.95 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  25.22 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  23.48 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  25.35 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.5 
 
 		 391 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  22.65 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.88 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  20.51 
 
 		 360 aa  67  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  24.75 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.88 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  20.28 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 792 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.04 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  23.99 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.1 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  22.83 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  18.56 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1510  permease YjgP/YjgQ family protein  22.76 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  24.23 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  25.57 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  20.16 
 
 		 1111 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  22.71 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  24.24 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  20.06 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  22.82 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  19.19 
 
 		 1153 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0112  permease YjgP/YjgQ family protein  21.85 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.378963  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.92 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  23.75 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 357 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.15 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0027  permease YjgP/YjgQ family protein  22.6 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1429  permease YjgP/YjgQ family protein  21.73 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398459  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0044  permease YjgP/YjgQ family protein  20.94 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484166  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  22.98 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.86 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  22.58 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  23.74 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  23.74 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  19.01 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  22.44 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  21.54 
 
 		 366 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 388 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  22.1 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  23.45 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  19.56 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  24.3 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.58 
 
 		 353 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  24.58 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  23.23 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  21.1 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 364 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 		 360 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2344  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  21.13 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6917  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.186439  normal  0.723746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  21.28 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  22.77 
 
 		 353 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  22.15 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>