197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0678 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  99.72 
 
 
362 aa  731    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  732    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  90.88 
 
 
362 aa  656    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  60.33 
 
 
363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  55.52 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  53.04 
 
 
359 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  48.88 
 
 
362 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  48.04 
 
 
362 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  48.88 
 
 
362 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  38.95 
 
 
362 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  38.12 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  39.62 
 
 
364 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  41.71 
 
 
362 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  41.71 
 
 
362 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  41.44 
 
 
362 aa  247  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  38.25 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  37.87 
 
 
365 aa  239  4e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  37.43 
 
 
365 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  35.69 
 
 
361 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  35.07 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  36.74 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  35.89 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  39.78 
 
 
363 aa  233  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  35.34 
 
 
362 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  34.53 
 
 
362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  35.81 
 
 
363 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  31.13 
 
 
364 aa  175  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  30.6 
 
 
364 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  30.6 
 
 
364 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  30.85 
 
 
366 aa  164  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  29.36 
 
 
364 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  31.06 
 
 
369 aa  161  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  31.87 
 
 
376 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  30.33 
 
 
365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  29.78 
 
 
367 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  31.71 
 
 
365 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  30.03 
 
 
373 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  26.65 
 
 
368 aa  124  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.95 
 
 
371 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.52 
 
 
362 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.73 
 
 
359 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  23.45 
 
 
366 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.14 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.14 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.12 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.17 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  22.87 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 
359 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 
353 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  22.54 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  23.28 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  22.04 
 
 
353 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  21.6 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 
356 aa  73.2  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.12 
 
 
356 aa  72.4  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  23.47 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.25 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  19.94 
 
 
369 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.06 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  22.84 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  19.94 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 
358 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  22.67 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  18.58 
 
 
365 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  21.45 
 
 
354 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  21.75 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  21.36 
 
 
369 aa  64.7  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  23.58 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  23.3 
 
 
360 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  20.75 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  22.93 
 
 
352 aa  62.8  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  23.24 
 
 
354 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  24.04 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  23.66 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  26.88 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  25.82 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  26.22 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  23.86 
 
 
357 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  21.13 
 
 
353 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.81 
 
 
1040 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  59.3  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  22.79 
 
 
386 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  22.79 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  22.79 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  22.52 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  22.36 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  22.79 
 
 
359 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  22.03 
 
 
355 aa  58.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.36 
 
 
352 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  21.61 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>