197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2627 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 376 aa  727    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  57.1 
 
 		 369 aa  377  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  42.47 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  39.73 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  38.9 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  37.3 
 
 		 366 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  37.53 
 
 		 361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  36.71 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  37.26 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  36.56 
 
 		 361 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  40 
 
 		 364 aa  216  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  35.62 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  34.52 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  38.27 
 
 		 364 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  37.06 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  38.81 
 
 		 364 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  38.81 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  36.07 
 
 		 362 aa  183  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  33.06 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  35.89 
 
 		 363 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  35.03 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  34.43 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  35.89 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  35.62 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  35.62 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  32.34 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  32.61 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  33.6 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  31.61 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  32.79 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  32.05 
 
 		 359 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  32.88 
 
 		 367 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  29.01 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  30.96 
 
 		 362 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  30.96 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  30.6 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  36.39 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  31.78 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  28.19 
 
 		 371 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.4 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.28 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  27.03 
 
 		 356 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  24.19 
 
 		 356 aa  85.9  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  27.32 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  25.2 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  27.54 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  25.26 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  25.2 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.44 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  26.59 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.66 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  27.3 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  25.47 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  26.5 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  24 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.04 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  24.93 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  28.21 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  22.43 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  24.52 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  27.86 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  25.58 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  26.18 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  25.34 
 
 		 354 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  28.53 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  27.6 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  25.78 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  26.75 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  27.03 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  27.99 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  26.8 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  24.7 
 
 		 353 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  24.86 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  25.68 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  27.56 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  24 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>