237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03633 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  715    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  93.26 
 
 		 356 aa  679    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2081  hypothetical protein  78.37 
 
 		 356 aa  578  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000262997  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  70.39 
 
 		 358 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  56.66 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  56.66 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  56.66 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  56.66 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  56.66 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  57.22 
 
 		 352 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  56.82 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  57.79 
 
 		 352 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  57.22 
 
 		 352 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  56.94 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  56.94 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  54.67 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  55.52 
 
 		 352 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  55.52 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  54.96 
 
 		 352 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  52.82 
 
 		 355 aa  385  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  51.83 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  52.39 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  52.69 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  48.03 
 
 		 356 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  52.66 
 
 		 356 aa  361  9e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04128  conserved inner membrane protein  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00895829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00436584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5784  putative permease  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000901519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4835  putative permease  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000478457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04092  hypothetical protein  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3750  permease YjgP/YjgQ family protein  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000963246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4743  putative permease  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000687106  normal  0.744445 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4518  putative permease  51.97 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000136034  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4818  putative permease  51.97 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000339649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  51.26 
 
 		 358 aa  358  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4865  inner membrane protein YjgQ  51.69 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000705517  normal  0.203916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4884  hypothetical protein  51.69 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4735  inner membrane protein YjgQ  51.69 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0130058  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4765  inner membrane protein YjgQ  51.69 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000537326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4828  inner membrane protein YjgQ  51.69 
 
 		 360 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  52.25 
 
 		 356 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3646  permease YjgP/YjgQ family protein  51.4 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000255423  normal  0.498711 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  51.26 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  51.26 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  51.26 
 
 		 358 aa  355  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  51.97 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0446  permease YjgP/YjgQ family protein  51.26 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  47.03 
 
 		 354 aa  315  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  38.53 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  40.62 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  37.96 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  39.09 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  38.81 
 
 		 354 aa  249  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  39.32 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  40.91 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  38.75 
 
 		 353 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  38.42 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  39.03 
 
 		 353 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  38.42 
 
 		 355 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  38.18 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  38.75 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  38.18 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  38.64 
 
 		 353 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11680  permease YjgP/YjgQ family  39.2 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.623053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  35.51 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  34.76 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  34.46 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  34.56 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  32.1 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  29.06 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  32.58 
 
 		 354 aa  186  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 357 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 354 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1746  permease YjgP/YjgQ  29.19 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.108168  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  31.82 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  30.59 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  28.99 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  30.77 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02662  putative permease, YjgP/YjgQ family  28.03 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  29.75 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  32.59 
 
 		 356 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  32.09 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  28.3 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2221  permease YjgP/YjgQ family protein  27.71 
 
 		 397 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.481086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  29.89 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2681  permease YjgP/YjgQ family protein  27.43 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2417  hypothetical protein  25.13 
 
 		 401 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0116  hypothetical protein  29.23 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0947899  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0100  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  32.62 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  26.06 
 
 		 382 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 		 386 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  28.35 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  28.35 
 
 		 359 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  28.35 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  27.98 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  28.35 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  25.8 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  25.8 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>