218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1813 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  100 
 
 		 364 aa  712    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  51.64 
 
 		 364 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  50.55 
 
 		 364 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  50.55 
 
 		 364 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  49.32 
 
 		 365 aa  328  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  46.76 
 
 		 368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  46.52 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  34.89 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  33.43 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  34.34 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  32.6 
 
 		 365 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  33.43 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  32.13 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  34.62 
 
 		 363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  33.15 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  33.52 
 
 		 361 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  34.25 
 
 		 362 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  35.15 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  32.96 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  32.16 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  34.59 
 
 		 362 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  34.79 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  35.36 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  35.36 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  35.08 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 367 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  29.2 
 
 		 362 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  29.48 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  32.34 
 
 		 359 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 		 362 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  30.14 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  28.37 
 
 		 362 aa  143  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 		 362 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  32.38 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  28.34 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  29.67 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  25 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 371 aa  107  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  27.02 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  26.52 
 
 		 356 aa  90.9  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  26.39 
 
 		 353 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  26.24 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  22.88 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  25.15 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  24.55 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  27.53 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  27.54 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  26.61 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1078  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000141824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  27.25 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  27.76 
 
 		 365 aa  82.8  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  26.23 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  23.71 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  25.96 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  27.24 
 
 		 352 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1374  SecD export membrane protein  24.72 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  23.68 
 
 		 387 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  21.59 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  23.85 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.61 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1235  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.104582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0621  permease YjgP/YjgQ family protein  23.06 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  26.91 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  27.22 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3117  permease YjgP/YjgQ family protein  27.24 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000809981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  25.76 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  27.24 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3107  permease YjgP/YjgQ family protein  27.24 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000202116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2101  hypothetical protein  23.69 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  25.08 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 792 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  25.08 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  24.05 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  27.07 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.35 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  25.61 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  25.35 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  24.26 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  26.15 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3260  permease YjgP/YjgQ family protein  26.93 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  23.94 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  21.07 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  26.02 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4009  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.137902  normal  0.604815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  26.02 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3640  membrane protein, YjgP/YjgQ like  23.02 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>